女职工在“三期”（孕期、产期、哺乳期）内的劳动权益确实受到《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规的严格保护。关于您提出的“三期内协商解除经济补偿金怎么算”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、经济补偿金的基本计算原则
经济补偿金是依据女职工在本单位的工作年限来计算的。具体来说：
工作年限计算：每满一年支付一个月工资作为经济补偿；工作六个月以上不满一年的，按一年计算；工作不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
月工资标准：月工资指的是女职工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。这个平均工资包括了计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。如果女职工的月平均工资高于当地月平均工资的三倍，那么经济补偿金的标准将按照当地月平均工资三倍的数额来支付，且支付年限最高不超过十二年。
二、协商解除劳动合同的经济补偿
如果用人单位与“三期”内的女职工协商一致解除劳动合同，那么用人单位需要按照上述的经济补偿金计算原则来支付经济补偿。这是基于双方自愿、平等协商的原则，也是用人单位对女职工在“三期”内可能面临的就业困难的一种补偿。
三、违法解除劳动合同的额外赔偿
如果用人单位违反法律规定解除或终止劳动合同，比如辞退处于“三期”内的女职工，那么除了需要支付正常的经济补偿金外，还需要依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。这意味着，女职工在遭遇违法解除时，可以获得相当于经济补偿金一倍的额外赔偿。
四、特殊情况下的处理
虽然“三期”内的女职工享有特殊保护，但如果女职工存在《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定的情形，比如严重违反用人单位规章制度、严重失职等，用人单位仍然可以合法解除劳动合同，且无需支付经济补偿金或赔偿金。
五、实际操作建议
保留证据：女职工在协商解除或遭遇违法解除时，应保留好相关证据，如劳动合同、工资条、辞退通知、沟通记录等，以便在后续维权时使用。
咨询专业律师：由于经济补偿金的计算涉及多个法律知识点，且实际情况可能复杂多变，建议女职工在涉及此类纠纷时及时咨询专业律师或劳动法律顾问，以确保自己的权益得到充分保障。
六、举例说明
假设某女职工在某公司工作了4年零7个月，其劳动合同解除前十二个月的平均工资为6000元。若公司在该女职工孕期与其协商一致解除劳动合同，那么公司需要支付的经济补偿金为：5个月（4年按4个月，7个月按1个月计算）× 6000元/月 = 30000元。如果公司是违法解除劳动合同，那么除了这30000元的经济补偿金外，还需要支付30000元的额外赔偿金，总共需要支付60000元。
综上所述，女职工在“三期”内的劳动权益受法律保护，用人单位在协商解除或违法解除劳动合同时应严格遵守相关法律法规，确保女职工的权益得到充分保障。在涉及经济补偿金计算等复杂问题时，建议寻求专业法律意见以确保合规性。