结论：单位没有为已辞职且劳动关系经仲裁确定的员工代交个人部分社保的义务。

分析如下：

1. 社保缴纳义务的主体与范围

   • 根据《社会保险法》第六十条，用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴。此处的“职工”指与单位存在劳动关系的在职员工。
   • 劳动关系终止后（如员工已辞职），单位与员工之间的社保代扣代缴关系随之终止。员工个人部分社保应由其自行向社保经办机构缴纳，单位无义务继续代扣代缴。

2. 仲裁确定劳动关系的性质

   • 劳动仲裁确认劳动关系的目的在于明确双方是否存在用工事实，进而确定权利义务关系。若仲裁裁决确认劳动关系已终止（如员工已辞职），则单位无需再履行在职期间的社保义务，包括代缴个人部分。
   • 若仲裁裁决确认劳动关系仍存续（如员工主张违法解除），则单位需按在职员工标准缴纳社保（包括代扣代缴个人部分），但此情形与“辞职员工”的前提矛盾，故不适用。

3. 特殊情形排除

   • 补缴历史欠费：若仲裁裁决单位需补缴劳动关系存续期间的社保（包括员工个人应缴部分），单位可依法从员工工资中扣除个人部分，但需满足以下条件：
     • 扣除金额不超过当月工资的20%；
     • 扣除后剩余工资不低于当地最低工资标准；
     • 需与员工书面协商一致或通过法律程序强制执行。
   • 员工自愿委托：若员工书面委托单位代缴离职后的个人社保，单位可协助办理，但此为自愿行为，非法定义务，且单位有权拒绝。

建议：

• 对单位而言，应在员工离职时及时办理社保减员手续，避免因代缴个人部分引发纠纷；
• 对员工而言，若需单位协助缴纳离职后社保，应签订书面协议明确权利义务，避免口头约定导致维权困难。

如有进一步疑问，可直接向我咨询。