“顶替扣挖掘机协议”是否合法，需根据协议的具体内容、签订背景及目的等多方面因素综合判断，无法直接给出合法或非法的绝对结论。不过，我可以从几个常见角度为你分析这类协议可能涉及的法律问题：
协议内容合法性：
- 如果“顶替扣挖掘机协议”涉及的是合法、正当的交易或安排，比如因工作需要临时调换挖掘机使用，且双方自愿、平等地签订协议，明确各自的权利和义务，那么这样的协议在内容上是合法的。
- 如果协议内容涉及非法活动，如通过顶替扣挖掘机来逃避债务、进行欺诈或洗钱等，那么这样的协议显然是非法的，不仅无效，还可能涉及刑事责任。
协议签订程序合法性：
- 协议的签订应当遵循自愿、平等、公平、诚实信用的原则。如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方在违背真实意愿的情况下签订协议，那么这样的协议是可以撤销的。
- 此外，如果协议涉及特定行业或领域的特殊规定（如建筑机械租赁、使用等），还需要确保协议签订程序符合这些特殊规定的要求。
协议履行中的法律问题：
- 即使协议本身合法且签订程序无误，但在履行过程中也可能出现法律问题。例如，如果一方未按照协议约定履行义务（如未按时支付租金、未妥善保管挖掘机等），就可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
- 另外，如果协议履行过程中发生意外事件（如挖掘机损坏、丢失等），也需要根据协议约定和法律规定来确定责任归属和赔偿方式。
针对你的情况，我有以下几点建议：
- 仔细审查协议内容：在签订任何协议之前，都要仔细阅读协议条款，确保自己完全理解并同意其中的内容。特别是要注意协议中的权利义务分配、违约责任等关键条款。
- 咨询专业人士：如果你对协议的法律效力或履行过程中可能出现的法律问题有疑问，建议咨询专业律师或法律机构。他们可以根据你的具体情况提供针对性的法律建议。
- 保留相关证据：在协议履行过程中，要注意保留与协议相关的证据（如支付凭证、沟通记录等）。这些证据在发生纠纷时可能起到关键作用。
如果你有更具体的协议内容或背景信息想要咨询，可以直接向我提问，我会根据你的具体情况给出更详细的法律分析。