事业单位员工治病超过两年后能否继续请假，需根据具体情况判断，主要涉及医疗期规定及单位规章制度。以下从不同角度进行分析：

1. 医疗期规定：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3个月到24个月不等。对于事业单位员工，虽然该规定直接针对的是企业职工，但事业单位在处理类似情况时，通常会参照此规定执行，或依据自身制定的规章制度。
   • 如果员工治病期间已经超过了其应享有的医疗期，那么单位有权根据规章制度或相关法律法规，决定是否继续批准请假。

2. 单位规章制度：

   • 事业单位通常会有自己的规章制度，其中会明确规定员工请假、病假等相关事宜。这些规章制度可能包括请假的流程、条件、期限以及超过期限后的处理方式等。
   • 如果员工治病超过两年，且已经超过了单位规章制度中规定的病假期限，那么单位有权依据规章制度拒绝继续批准请假。但在此之前，单位应确保规章制度的内容合法、合理，且已经向员工进行了公示或告知。

3. 特殊情况处理：

   • 如果员工因病情严重确实需要继续治疗，且能够提供有效的医疗证明，那么单位在考虑人道主义因素及员工实际情况后，可能会酌情批准继续请假。但这并非法定权利，而是单位基于人文关怀的自主决定。
   • 另外，如果员工在医疗期内或医疗期满后，因病情导致无法从事原工作，也无法从事单位另行安排的工作，那么单位有权依据《劳动合同法》的相关规定，与员工解除劳动合同，但需支付相应的经济补偿。

建议：

• 对于员工而言，如果治病超过两年且希望继续请假，应首先了解自己的医疗期期限及单位规章制度中关于病假的相关规定。同时，积极与单位沟通，提供有效的医疗证明，说明自己的病情及治疗需要，争取单位的理解和支持。
• 对于单位而言，在处理此类情况时，应确保遵循相关法律法规及规章制度，保障员工的合法权益。同时，也可以考虑与员工协商，寻找双方都能接受的解决方案，如调整工作岗位、安排部分工作等。

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