结论前置：在摩托车不过户但签订了买卖协议的情况下，若后续出现问题，责任归属需根据具体情况来判断，一般而言，若协议合法有效且能证明车辆已实际交付，原车主（卖方）通常不承担因车辆使用产生的直接责任，但可能需承担因未过户导致的行政责任或特定情况下的连带责任；若协议存在瑕疵或车辆未实际交付，则责任归属可能更为复杂。以下从不同角度详细分析：
一、协议合法有效且车辆已实际交付的情况
民事责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，动产物权的设立和转让，自交付时发生效力。因此，若摩托车买卖协议合法有效，且车辆已实际交付给买方，则车辆的所有权已转移至买方。在此情况下，因车辆使用产生的直接责任（如交通事故责任）通常应由买方承担。
- 卖方在协议中应明确告知买方车辆未过户的情况，并要求买方尽快办理过户手续。若卖方已尽到告知义务，且买方未办理过户手续导致的问题，卖方一般不承担责任。
行政责任：
- 尽管民事责任可能由买方承担，但卖方作为原车主，若因未过户导致车辆信息仍登记在其名下，可能面临交通管理部门的处罚，如罚款、扣分等。因此，卖方应督促买方尽快办理过户手续，以避免不必要的行政责任。
二、协议存在瑕疵或车辆未实际交付的情况
协议瑕疵：
- 若摩托车买卖协议存在瑕疵，如未明确约定车辆交付时间、地点、方式等关键条款，或协议内容违反法律法规的强制性规定，则协议可能被认定为无效或可撤销。在此情况下，若车辆未实际交付或交付存在争议，责任归属可能更为复杂。
- 卖方可能需承担因协议瑕疵导致的法律责任，如返还买方已支付的款项、赔偿买方因此遭受的损失等。
车辆未实际交付：
- 若车辆未实际交付给买方，则车辆的所有权仍属于卖方。在此情况下，若车辆发生交通事故或其他问题，卖方作为车主可能需承担相应的法律责任。
- 卖方应确保车辆已实际交付给买方，并保留好交付证据（如交付照片、视频、签收单等），以证明车辆已转移至买方控制之下。
三、特殊情况下的连带责任
- 在某些特殊情况下，如卖方明知车辆存在严重安全隐患或违法情况仍出售给买方，或卖方与买方恶意串通损害第三方利益等，卖方可能需承担连带责任。
- 卖方在出售摩托车前，应对车辆进行全面检查，确保车辆符合安全标准且无违法情况。同时，卖方应避免与买方恶意串通损害第三方利益，以维护自身合法权益。
法律建议：
- 完善协议内容：在签订摩托车买卖协议时，应明确约定车辆交付时间、地点、方式等关键条款，并确保协议内容合法有效。
- 及时办理过户手续：车辆交付后，卖方应督促买方尽快办理过户手续，以避免不必要的行政责任和法律风险。
- 保留交付证据：卖方应保留好车辆交付的证据（如交付照片、视频、签收单等），以证明车辆已转移至买方控制之下。
- 咨询专业律师：若在摩托车买卖过程中遇到法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和指导。
可能法律后果：
- 若因未过户导致的问题被追究法律责任，卖方可能面临民事赔偿、行政处罚等后果。
- 若协议存在瑕疵或车辆未实际交付导致的问题被追究法律责任，卖方可能需承担返还款项、赔偿损失等后果。
- 在特殊情况下，卖方可能需承担连带责任，面临更严重的法律后果。