结论：国家工作人员受贿50万元，即使已经退还且超过追诉期，仍然可能面临开除公职的处分。具体是否开除，需结合案件具体情况、单位规定以及相关法律法规进行综合判断。

分析说明：

1. 受贿行为的性质：

   • 受贿是严重的违法犯罪行为，无论金额大小，都损害了国家工作人员的职务廉洁性，破坏了社会的公平正义。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，受贿数额较大的，将面临刑事处罚。虽然本题中提到已经超过追诉期，但这并不改变受贿行为的违法性。

2. 退还受贿款项的影响：

   • 退还受贿款项是犯罪嫌疑人或被告人的一种悔罪表现，可以在一定程度上减轻其刑事责任。
   • 然而，退还受贿款项并不意味着可以完全免除其违法行为的后果，特别是在公职处分方面。

3. 追诉期与公职处分的关系：

   • 追诉期是刑事诉讼中的一个重要概念，它指的是对犯罪嫌疑人或被告人进行刑事追诉的有效期限。
   • 超过追诉期，意味着犯罪嫌疑人或被告人将不再面临刑事处罚。但这并不影响其因违法行为而应承担的其他责任，如公职处分。

4. 公职处分的依据：

   • 根据《中华人民共和国公务员法》等相关法律法规，国家工作人员因违法行为受到刑事处罚的，应当给予开除处分。
   • 即使未受到刑事处罚，但如果其行为严重违反了公务员的职业道德和纪律要求，单位也有权根据内部规定给予相应的处分，包括开除公职。

5. 具体案件的综合判断：

   • 在本题中，虽然受贿行为已经超过追诉期，但单位在决定是否给予开除公职处分时，会综合考虑多种因素，如受贿金额的大小、行为的性质、退还受贿款项的情况、对单位和社会的影响等。
   • 如果单位认为该行为严重违反了公务员的职业道德和纪律要求，且对单位和社会造成了不良影响，那么即使超过追诉期，也有可能给予开除公职的处分。

行动建议：

• 对于涉及此类情况的国家工作人员，建议主动向单位说明情况，积极配合调查，并表现出真诚的悔罪态度。
• 同时，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
• 如果单位决定给予开除公职处分，且该决定存在不合理或违法之处，可以通过法律途径维护自己的合法权益。

后续思考：

• 国家工作人员应时刻牢记自己的职责和使命，严格遵守法律法规和职业道德规范，避免陷入违法犯罪的泥潭。
• 单位在处理此类案件时，应坚持公正、公平、公开的原则，确保处理结果的合法性和合理性。
• 社会应加强对国家工作人员的监督和管理，共同营造一个风清气正的政治生态。