法院不同意男方在女方提出离婚时要求做亲子鉴定，通常基于以下几个法律和程序上的考量：

1. 缺乏合理依据：

   • 亲子鉴定是一项严肃的法律程序，其启动通常需要有一定的合理依据或初步证据表明可能存在非亲生子女的情况。如果男方仅凭主观怀疑或无确凿证据的情况下要求进行亲子鉴定，法院可能会认为这种要求缺乏合理性和必要性，从而不予支持。

2. 保护女方及子女权益：

   • 法院在处理家庭纠纷时，会特别注重保护妇女和儿童的合法权益。如果亲子鉴定的要求可能对女方或子女造成不必要的心理压力、名誉损害或其他负面影响，且没有充分的理由支持这一要求，法院可能会出于保护目的而拒绝。

3. 程序正当性：

   • 亲子鉴定的进行需要遵循严格的法律程序，包括当事人的同意、鉴定机构的资质等。如果男方在提出离婚时突然要求进行亲子鉴定，而没有按照法定程序进行申请和准备，法院可能会认为这种要求不符合程序正当性的要求，因此不予批准。

4. 婚姻关系存续期间的信任基础：

   • 婚姻关系是建立在相互信任的基础上的。如果男方在婚姻关系存续期间没有提出过对子女亲生关系的质疑，而在离婚时突然提出，这可能会被视为对婚姻信任基础的破坏。法院在处理此类纠纷时，会综合考虑婚姻关系的整体状况，包括双方的感情基础、婚姻期间的相处情况等，来决定是否支持男方的亲子鉴定要求。

针对您的情况，我有以下几点建议：

• 沟通协商：首先，我建议男方与女方进行坦诚的沟通，了解女方不同意亲子鉴定的具体原因，并尝试通过协商找到双方都能接受的解决方案。
• 收集证据：如果男方确实对子女的亲生关系存在合理怀疑，可以尝试收集相关证据，如医疗记录、家族病史等，以支持其亲子鉴定的要求。但请注意，这些证据必须合法、有效，且能够形成完整的证据链。
• 寻求法律帮助：如果双方无法就亲子鉴定问题达成一致，男方可以寻求专业律师的帮助，了解相关法律规定和程序要求，以便更好地维护自己的合法权益。

最后，需要强调的是，亲子鉴定是一项严肃的法律程序，其结果可能对家庭关系产生深远影响。因此，在决定是否进行亲子鉴定时，请务必慎重考虑，并遵循法律程序和道德规范。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。