针对男女双方分别起诉离婚且在同一法院均已立案的情况，法院通常会根据《民事诉讼法》及相关司法解释的规定，通过合并审理或指定管辖等方式处理，以避免重复诉讼和司法资源浪费，具体处理方式如下：
法院会审查双方起诉的先后顺序及案件关联性
若一方先起诉，法院立案后发现另一方也已就同一婚姻关系提起离婚诉讼，通常会根据《民事诉讼法》第154条“重复起诉”的规定，将后立案的案件移送至先立案的法院合并审理。合并审理的目的是统一审理事实、证据和法律适用，避免出现相互矛盾的判决。
若双方起诉时间相近或难以区分先后，法院可能指定同一合议庭审理
实践中，若双方起诉时间接近（如同一天立案），法院可能通过内部协调，指定同一审判组织（如同一合议庭）对两案进行合并审理。此时，法院会合并双方诉求（如财产分割、子女抚养等），一次性解决争议，减少当事人诉累。
法院会重点审查双方诉求是否存在冲突或重叠
在合并审理中，法院会要求双方明确诉讼请求（如是否均主张离婚、财产分割方案等）。若一方主张离婚而另一方不同意，法院需根据《民法典》第1079条判断感情是否确已破裂；若双方均主张离婚，法院会直接进入实体审理，重点处理财产分割、子女抚养等争议。
特殊情形：一方撤诉或法院裁定驳回起诉
若一方在审理过程中撤诉，法院会裁定准予撤诉，另一方案件继续审理；若一方起诉不符合法定条件（如未满足离婚冷静期要求、重复起诉等），法院可能裁定驳回起诉，此时另一方案件不受影响。
温馨提示：离婚诉讼涉及身份关系和财产权益，建议双方在诉讼前尽量协商或通过调解解决争议。若已进入诉讼程序，需注意提交完整证据（如结婚证、财产凭证、子女出生证明等），并明确诉讼请求，以便法院高效审理。如有具体问题，可直接向我咨询，我会结合案件细节提供进一步分析。