男女双方一般不可以分别在不同的法院起诉离婚，但在特定情形下，可能存在不同法院管辖的情况。下面我将从不同角度为您详细分析：
一、一般原则：被告住所地或经常居住地法院管辖
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对公民提起的民事诉讼，原则上由被告住所地人民法院管辖；若被告住所地与经常居住地不一致，则由经常居住地人民法院管辖。这意味着，在一般情况下，离婚诉讼应由被告的住所地或经常居住地法院管辖，男女双方不能随意选择在不同的法院起诉。
二、特定情形下的管辖原则
一方离开住所地超过一年，另一方起诉离婚：
- 在此情况下，原告（未离开住所地的一方）可以选择在自己住所地的法院提起诉讼，或者如果被告（离开住所地的一方）有明确的经常居住地，也可以在被告经常居住地的法院起诉。但需要注意的是，这并不意味着男女双方可以分别在不同的法院起诉，而是原告在选择起诉法院时有一定的灵活性。
双方均离开住所地超过一年：
- 当夫妻双方都离开了原住所地，且均在外地生活超过一年时，起诉离婚的一方需向被告的经常居住地法院提出诉讼。若被告无经常居住地，则由原告起诉时被告的实际居住地法院管辖。这种情况下，同样不存在男女双方分别在不同法院起诉的可能性。
特殊情形下的管辖：
- 若被告一方被注销城镇户口，或被告被监禁、采取强制性教育措施，以及非军人对军人提出的离婚诉讼等特殊情况，均由原告住所地法院管辖；若原告住所地与经常居住地不一致，则由原告经常居住地法院管辖。这些规定确保了在不同特殊情境下，当事人仍能找到合适的法院提起诉讼，但同样不适用于男女双方分别在不同法院起诉的情形。
三、实际操作建议
- 准备充分证据：在决定起诉离婚前，务必收集并准备好相关证据材料，如居住证明、婚姻状况证明等，以证明法院的管辖权。
- 咨询专业律师：由于法律规定和程序要求可能因地区而异，且离婚诉讼涉及诸多法律问题和情感纠葛，建议在起诉前咨询专业律师，如我本人，以确保了解并遵守具体的法律规定，同时获得情感上的支持和法律上的指导。
- 遵循法院程序：在提起诉讼后，应遵循法院的程序规定，按时出庭、提交证据等，以确保诉讼的顺利进行。
总结来看，男女双方在一般情况下不能分别在不同的法院起诉离婚。但在特定情形下，如一方离开住所地超过一年或双方均离开住所地超过一年等，原告在选择起诉法院时可能有一定的灵活性。不过，这种灵活性并不等同于男女双方可以分别在不同的法院起诉。因此，在面临离婚诉讼时，建议男女双方协商一致，共同选择一个合适的法院进行诉讼，或者咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何法律问题，都可以直接向我咨询。