旷工3天扣工资的具体方式需结合公司规章制度、劳动合同及地方性法规综合判断，但通常遵循以下原则：

1. 公司规章制度优先
   若公司《员工手册》或《考勤管理制度》明确规定“旷工1天扣X倍日工资，旷工3天可解除劳动合同并扣发当月绩效工资”，且该制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论）、向员工公示（如签字确认或系统公告），则公司可按制度执行。
   示例：若日工资为300元，制度规定旷工1天扣3倍日工资，则旷工3天可能扣2700元（300×3×3），但需确保扣除后工资不低于当地最低工资标准。

2. 劳动合同约定
   若劳动合同中单独约定了旷工扣薪条款（如“旷工3天扣发当月奖金”），且条款不违反法律强制性规定（如未约定“旷工即自动离职且不支付工资”），则该约定有效。
   注意：若制度与合同冲突，通常以对员工更有利的条款为准。

3. 地方性法规限制
   部分地区对工资扣除有上限规定。例如：

   • 《广东省工资支付条例》：因员工原因造成经济损失需赔偿的，每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后不低于最低工资标准。
     
   • 《江苏省工资支付条例》：除法定情形外，用人单位不得克扣工资；若旷工导致公司损失，需通过劳动仲裁或诉讼主张赔偿，而非直接扣工资。
     建议：先查询所在省份的工资支付条例，避免公司违法操作。

4. 合法性底线
   无论何种情况，扣除工资后剩余部分不得低于当地最低工资标准。例如，若月工资5000元，最低工资2280元，即使旷工3天，公司最多只能扣2720元（5000-2280）。

行动建议：

1. 核查制度：要求公司出示经公示的规章制度，确认旷工扣薪的具体条款；
   
2. 核对计算：要求公司提供工资条，明确扣除项目及金额是否合理；
   
3. 协商或投诉：若认为扣除违法，可先与公司协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
   

如有进一步细节（如公司所在地、制度具体内容），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。