结论：公司给予证书特殊奖励并约定服务年限，这一做法在符合一定条件下是合法的。

详细分析：

1. 法律依据与合法性基础：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以约定服务期，但前提是用人单位为劳动者提供了专项培训费用，对其进行专业技术培训。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“证书特殊奖励”作为约定服务期的条件，但我们可以从法律原则和精神上进行推断。如果公司给予的证书特殊奖励可以视为对劳动者的一种额外投资或福利，且这种奖励与劳动者的专业技能提升或公司业务发展紧密相关，那么在一定程度上，可以类比为“专项培训”的一种形式。然而，这种类比并非绝对，具体还需根据奖励的性质、目的以及双方的实际约定来判断。
   • 更为直接且明确的是，如果双方通过协商一致，在劳动合同或补充协议中明确约定了证书特殊奖励与服务年限的关联，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，不损害劳动者的合法权益，那么这种约定是具有法律效力的。

2. 约定服务年限的合理性考量：

   • 公司在给予证书特殊奖励时，约定一定的服务年限，其目的通常是为了确保劳动者能够长期为公司服务，从而保障公司的投资回报和业务稳定。这种约定在商业实践中是常见的，也是合理的。
   • 但是，服务年限的约定应当合理，不能过长或过短，且应当与奖励的价值相匹配。如果服务年限过长，或者奖励的价值与实际服务要求不成比例，那么这种约定可能会被视为显失公平，从而面临被法院或仲裁机构调整或撤销的风险。

3. 劳动者权益保护：

   • 劳动者在签订相关协议时，应当仔细阅读条款，了解自己的权利和义务。如果对于服务年限的约定有疑问或不满，应当及时与公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。
   • 如果公司违反约定，未按照协议给予证书特殊奖励，或者要求劳动者承担不合理的服务年限义务，劳动者有权依法维护自己的合法权益，包括向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。

4. 实际操作建议：

   • 对于公司而言，在给予证书特殊奖励并约定服务年限时，应当确保约定的合法性和合理性，明确双方的权利和义务，避免产生不必要的法律纠纷。
   • 对于劳动者而言，在签订相关协议前，应当充分了解自己的权益和义务，对于不合理的约定应当及时提出异议并寻求解决方案。如果遇到法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

总结：公司给予证书特殊奖励并约定服务年限，在符合法律法规和双方协商一致的前提下是合法的。但双方应当确保约定的合理性和合法性，并充分了解自己的权利和义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。