在两个执行案件中，若一方不同意债务互相抵消，法院通常不会直接判决债务抵消，而是会依据具体情况进行审理并作出相应判决。以下从不同角度为你详细分析：
一、债务抵消的法律规定与条件
根据《中华人民共和国民法典》第五百六十八条的规定，当事人互负债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定不得抵销的除外。同时，第五百六十九条也规定了当事人互负债务，标的物种类、品质不相同的，经协商一致，也可以抵销。
债务抵消需满足以下条件：
- 双方互负债务：即两个执行案件中的债务必须相互存在，且均未清偿。
- 债务标的物种类、品质相同或经协商一致：若种类、品质不相同，则需双方协商一致才能抵消。
- 债务均已到期：只有到期的债务才能进行抵消。
- 不属于不得抵消的情形：如根据债务性质、当事人约定或法律规定不得抵消的债务，则不能进行抵消。
二、一方不同意债务抵消时的法院处理
若债务抵消条件不满足：
- 若两个执行案件中的债务不满足上述抵消条件，如债务未到期、标的物种类品质不相同且未经协商一致、或属于不得抵消的情形等，则法院不会支持债务抵消的请求。
- 在此情况下，法院会继续对两个执行案件进行分别审理，并根据各自的事实和法律规定作出判决。
若债务抵消条件满足，但一方不同意：
- 即使债务抵消条件满足，若一方不同意抵消，法院也不会直接判决债务抵消。因为债务抵消需要双方当事人的合意，单方面主张抵消通常不会被法院支持。
- 在此情况下，法院会组织双方进行调解，尝试促成双方就债务抵消达成一致意见。若调解成功，则法院可以制作调解书，确认债务抵消的效力。
- 若调解不成，法院会继续对两个执行案件进行分别审理，并根据各自的事实和法律规定作出判决。在判决中，法院会明确双方各自应承担的债务金额和履行方式等。
三、实际操作中的建议
- 积极沟通协商：在两个执行案件中，若双方均认为债务抵消有利于自身利益，应积极沟通协商，尝试达成一致意见。这有助于减少诉讼成本和时间成本，提高纠纷解决效率。
- 准备充分证据：若一方主张债务抵消，应准备充分的证据证明债务抵消的条件已满足，如债务到期证明、标的物种类品质相同证明等。这有助于增加法院支持债务抵消请求的可能性。
- 寻求专业法律帮助：在处理涉及债务抵消的复杂法律问题时，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助当事人更好地维护自身权益。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，法院在处理时会根据案件事实和法律规定进行综合判断。因此，在处理涉及债务抵消的问题时，应充分考虑案件的具体情况和法律规定，并寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善维护。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。