股东在发现实际控制人吃回扣的情况下，是有可能追回相关损失的，但具体能否追回以及追回的方式，需根据实际情况和法律规定来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与依据
公司法相关规定：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的董事、监事、高级管理人员应当遵守法律、行政法规和公司章程，对公司负有忠实义务和勤勉义务。实际控制人虽然不一定直接担任公司董事、监事或高级管理人员，但如果其通过控制公司决策或影响公司运营来谋取私利，同样可能违反忠实义务。
- 若实际控制人利用其地位，通过吃回扣等方式损害公司利益，股东有权依据公司法规定，要求实际控制人承担赔偿责任。
刑法相关规定：
- 如果实际控制人吃回扣的行为构成犯罪，如非国家工作人员受贿罪或职务侵占罪等，股东还可以向公安机关报案，追究其刑事责任。在刑事诉讼过程中，股东可以作为被害人或证人参与，并有权要求犯罪嫌疑人退赔违法所得。
二、追回损失的具体途径
内部救济途径：
- 股东会或董事会决议：股东可以提议召开股东会或董事会，通过决议要求实际控制人停止侵害公司利益的行为，并赔偿公司损失。
- 公司内部调查：公司可以成立内部调查小组，对实际控制人吃回扣的行为进行调查，并根据调查结果采取相应的法律措施。
外部救济途径：
- 民事诉讼：股东可以代表公司提起民事诉讼，要求实际控制人赔偿公司因吃回扣行为所遭受的损失。在诉讼过程中，股东需要提供充分的证据证明实际控制人的违法行为以及公司因此遭受的损失。
- 刑事报案：如前所述，如果实际控制人的行为构成犯罪，股东可以向公安机关报案，要求追究其刑事责任，并退赔违法所得。
三、实际操作中的注意事项
证据收集：
- 股东在追回损失的过程中，必须注重证据的收集和保存。这包括但不限于合同、发票、银行转账记录、聊天记录等能够证明实际控制人吃回扣行为的证据。
法律程序：
- 股东在采取法律措施时，必须遵循法律程序。例如，在提起民事诉讼前，可能需要先履行内部救济程序；在刑事报案时，需要向公安机关提供充分的证据和线索。
专业协助：
- 由于法律问题的复杂性和专业性，股东在追回损失的过程中，可能需要寻求专业律师的协助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助股东更好地维护自身权益。
四、可能面临的挑战与风险
证据不足：
- 如果股东无法提供充分的证据证明实际控制人的违法行为以及公司因此遭受的损失，那么追回损失的可能性将会大大降低。
实际控制人反抗：
- 实际控制人可能会采取各种手段来反抗股东的追索行为，如否认违法行为、转移资产等。这要求股东在追索过程中保持警惕，并采取相应的法律措施来应对。
法律程序复杂：
- 法律程序往往复杂且耗时较长，股东需要做好充分的准备和耐心。同时，法律程序也可能涉及一定的费用支出，股东需要对此有所预期。
总结来说，股东在发现实际控制人吃回扣的情况下，是有可能通过法律途径追回相关损失的。但具体能否追回以及追回的方式，需根据实际情况和法律规定来综合判断。如果你作为股东遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。