结论：公司人力资源部规定“请病假超四天，扣除十三一半”的做法是否合法，需结合具体情况判断，但一般情况下，这种规定可能涉嫌违法，因为病假工资的扣除需遵循法定标准，不能随意设定。以下从多个角度进行分析：

一、病假工资的法定标准

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及各地关于病假工资的具体规定，职工在病假期间，用人单位应按照一定比例支付病假工资或疾病救济费。具体比例通常根据职工的工龄、病假时长等因素确定，但不得低于当地最低工资标准的80%（具体比例可能因地区而异，需参照当地规定）。

二、公司规定的合法性分析

1. 若公司规定低于法定标准：

   • 如果公司规定的“扣除十三一半”意味着病假工资低于当地最低工资标准的80%，或者未按照法定比例支付，那么这种规定是违法的。
   • 例如，若当地最低工资标准为2000元/月，则病假工资不得低于1600元/月。若公司规定病假超过四天即扣除一半工资，导致实际支付的病假工资低于1600元/月，则该规定违法。

2. 若公司规定高于法定标准但存在不合理性：

   • 即使公司规定的病假工资扣除比例高于法定最低标准，但如果该规定显得过于苛刻或不合理，也可能引发劳动争议。
   • 例如，若公司规定病假超过四天即扣除全部奖金或绩效工资的一半，而这部分收入原本属于职工的正常劳动报酬，则该规定可能因缺乏合理性而被认定为违法或无效。

3. 若公司规定与劳动合同或集体合同冲突：

   • 如果公司规定与劳动合同或集体合同中关于病假工资的约定相冲突，那么应以劳动合同或集体合同的约定为准。
   • 劳动合同或集体合同是劳动者与用人单位之间协商一致的结果，具有更高的法律效力。因此，公司规定不得违反这些合同中的约定。

三、法律建议

1. 与公司协商：

   • 如果你认为公司的病假工资规定违法或不合理，可以首先与公司人力资源部进行协商，寻求合理的解决方案。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理。

3. 申请劳动仲裁：

   • 如果劳动监察部门未能解决问题，你还可以向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

四、可能的法律后果

• 如果公司规定被认定为违法或无效，公司可能需要补发你的病假工资差额，并可能面临劳动行政部门的处罚。
• 同时，这种违法行为也可能影响公司的声誉和员工关系，对公司的长期发展不利。

总结：公司人力资源部规定“请病假超四天，扣除十三一半”的做法是否合法，需结合具体情况判断。但无论如何，病假工资的扣除都需遵循法定标准，不能随意设定。如果你认为公司的规定违法或不合理，建议与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如有其他疑问，欢迎直接向我咨询。