合同违约赔款5万是否合法，需根据具体情况判断，主要取决于合同约定、实际损失以及公平原则等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、合同约定的合法性
双方自愿约定：
- 根据《民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。因此，如果合同双方在平等、自愿的基础上明确约定了5万违约金，且该约定不违反法律的强制性规定，那么这一约定是具有法律效力的。
不违反法律强制性规定：
- 违约金的约定不得违反法律的强制性规定，如不得约定过高的违约金以损害对方利益，或约定与合同内容无关的违约金等。如果5万违约金的约定符合法律要求，那么它是合法的。
二、实际损失与违约金的关系
补偿实际损失：
- 违约金的首要目的是补偿因违约造成的实际损失。如果5万违约金未超过实际损失的合理范围（一般以不超过造成损失的百分之三十较为常见），则通常视为合理且合法。
过高违约金的调整：
- 如果5万违约金明显高于实际损失，可能被视为过高，有违公平原则。此时，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求适当减少违约金数额。
三、具体情境下的分析
合同标的额的影响：
- 对于大额合同，如千万级别的商业合作，5万违约金可能不足以形成有效威慑，也不足以弥补可能的损失，但这并不直接导致其不合法，只是可能在实际操作中显得不合理。
- 对于小额合同，如几万元的买卖合同，5万违约金则可能明显过高，超出了合理损失范围，此时可能面临被调整的风险。
违约行为可能造成的损失：
- 如果违约行为可能导致巨大经济损失，如错过重大商业机会、生产停滞等，5万违约金可能是合理的，甚至可能不足以弥补全部损失。
- 如果违约行为造成的损失较小，如轻微延误或小瑕疵，则5万违约金显然过高，可能面临被调整或认定为不合法的风险。
行业惯例与类似案例的参考：
- 特定行业内可能有关于违约金的通行标准或大致范围。如果5万违约金符合行业惯例，则相对合理且合法；反之，则可能不合理且面临被调整的风险。
- 参考类似合同纠纷案件的判决结果，也能为违约金的合理性判断提供有力依据。
四、建议与指导
合同签订时的注意事项：
- 在签订合同时，双方应充分协商违约金的数额和计算方式，确保既合理又合法。
- 违约金条款应明确、具体，避免模糊不清或产生歧义。
争议解决途径：
- 如果对违约金的合理性存在疑问或争议，双方可以首先尝试通过协商解决。
- 如果协商不成，可以诉诸法院或仲裁机构进行裁决和调整。在诉讼或仲裁过程中，双方应提供充分的证据证明自己的主张。
总结来说，合同违约赔款5万是否合法取决于多种因素的综合考量，包括合同双方的约定、实际损失的大小、公平原则以及具体情境下的分析等。在实际操作中，建议合同双方在签订合同时充分协商并明确违约金的数额和计算方式，以确保既合理又合法。如果有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。