结论前置：按照实际工作日折算日工资，在大多数情况下是合法的，但必须严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益不受侵害。
法律依据与合法性分析
法律规定：
- 根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，月计薪天数为21.75天，用人单位可以此为基础，结合员工实际出勤天数来计算工资。这一规定体现了按劳分配的原则，符合劳动法律法规的基本要求。
- 《中华人民共和国劳动法》第四十七条也明确赋予用人单位依法自主确定本单位工资分配方式和工资水平的权利。
合法性条件：
- 工资计算方式需在劳动合同中有明确约定，且不违反法律法规的强制性规定。如果劳动合同中未明确约定，但双方在实际操作中已形成惯例，且该惯例不违反法律法规，也可视为合法。
- 即使按实际工作日折算日工资，劳动者的工资报酬也不得低于当地最低工资标准。这是保障劳动者基本生活需求的重要法律底线。
具体计算方式与注意事项
计算方式：
- 日工资的计算公式通常为：日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数（21.75天）。
- 实际工资 = 日工资 × 实际出勤天数。
- 示例：假设某员工月工资为5000元，当月实际出勤天数为20天，则其日工资为5000元 ÷ 21.75天 ≈ 229.89元，实际工资为229.89元 × 20天 = 4597.8元。
注意事项：
- 加班费：对于加班情况，用人单位必须严格按照法律规定支付加班费。加班费应按照平时延时加班、周末加班以及法定节假日加班的不同标准进行计算，并不得仅按实际出勤日计算正常工作时间工资来替代加班费。
- 带薪假期：员工依法享有的带薪年假、病假（在规定医疗期内）、婚假、产假、陪产假等带薪假期，用人单位应视为正常出勤并支付工资。这些假期不能作为扣除工资的理由。
- 劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了其他工资计算方式，如固定月薪等，用人单位应严格按照合同约定执行。未经劳动者同意，用人单位不得单方面改变工资计算方式。
特殊情况的处理
未满足最低工资标准：
- 若按实际工作日折算日工资后，劳动者的工资低于当地最低工资标准，则构成违法。用人单位应立即调整工资计算方式，确保劳动者的工资不低于最低工资标准。
存在加班未支付加班费：
- 如果用人单位仅按实际出勤日计算了正常工作时间的工资，而未依法支付加班费，则构成违法。劳动者有权要求用人单位支付加班费，并可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
违反劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了工资计算方式，而用人单位单方面改变为按实际工作日折算日工资，且未经劳动者同意，则构成违约。劳动者有权要求用人单位按照原合同约定支付工资，并可寻求法律救济。
综合建议
在处理工资按照实际工作日折算的问题时，用人单位应确保工资计算方式的合法性与合理性，严格遵守相关法律法规及劳动合同约定。同时，劳动者也应了解自身权益，如发现用人单位存在违法行为或违约行为，应及时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁以维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。