结论：公司发工资直接转账，在遵守相关法律法规的前提下，是合法且常见的支付方式。不过，具体是否违法还需结合转账主体（公司账户还是私人账户）、是否遵守税务及社保法规等因素综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、公司账户直接转账发工资的合法性
法律依据：
- 根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位有权选择将工资支付给劳动者本人，包括通过银行代发的方式。这明确了公司采用银行转账支付工资的合法性。
普遍性与优势：
- 普遍性：在实际操作中，许多公司都选择通过银行转账的方式发放工资，这种方式既符合现代支付习惯，也便于管理和记录。
- 优势：
- 对企业而言，银行转账提高了财务工作效率，有利于成本核算和税务申报。
- 对员工而言，工资直接到账避免了现金保管的风险，且方便查询工资明细，保障了知情权。
需遵循的其他规定：
- 公司在处理员工工资时，还需确保支付周期、支付方式等符合当地劳动法规的要求。
- 同时，应严格保护员工的个人信息安全，避免信息泄露或滥用。
二、私人账户转账发工资的合法性判断
合法情况：
- 小型企业或个体工商户的常见操作：对于经营规模小、人员少的小型企业或个体工商户而言，由于财务制度可能不够完善，企业主使用私人账户给员工发放工资，在按照规定代扣代缴个人所得税，并如实进行财务记录和税务申报的情况下，是合法的。
- 特殊情况下的临时安排：如遇银行账户被冻结、系统故障等特殊情况，企业为确保员工工资按时发放，可能会临时采用私人账户转账。只要事后及时恢复正常的工资发放渠道，并做好相关财务处理和税务申报，这种临时安排也是合法的。
违法情况：
- 逃避税务义务：企业通过私人账户发放部分或全部工资，以规避税务申报和缴纳，导致员工应税收入减少，企业也少缴税款，这种行为违反了《中华人民共和国税收征收管理法》，构成偷税漏税，需承担相应的法律责任。
- 侵害员工权益：使用私人账户发工资可能影响员工的社保缴纳基数，导致社保权益受损，同时也不利于员工在劳动纠纷中证明劳动关系和工资数额。这种行为违反了《中华人民共和国社会保险法》等相关规定，损害了员工的合法权益。
- 违反财务管理制度：企业财务制度和会计准则要求资金往来应通过对公账户进行，以保证财务透明度和规范性。使用私人账户发工资可能导致企业财务账目混乱，难以进行有效的财务管理和审计监督，违反了《中华人民共和国会计法》等相关法律法规。
三、建议与风险提示
建议：
- 为避免不必要的法律风险和纠纷，企业应遵守相关法律法规和财务规定，确保以合法方式向员工支付工资，并使用正规的对公账户进行工资发放。
- 如有特殊情况需要临时使用私人账户转账，应及时向税务和劳动部门报备，并确保后续财务处理和税务申报的合规性。
风险提示：
- 若企业利用私人账户转账发工资逃避税务或社保义务，将面临税务处罚、社保补缴及可能的劳动纠纷等法律风险。
- 员工在收到工资时，也有权要求企业提供正规的工资条和税务发票，以维护自己的合法权益。
总结：公司发工资直接转账本身并不违法，但需确保转账主体合法（优先使用公司账户）、遵守税务及社保法规，并保护员工个人信息。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。