结论前置：征地拆迁程序违法签的协议，其效力需根据具体情况判断，可能无效、可撤销或有效。以下是对此问题的详细分析：
一、协议可能无效的情形
违反法律强制性规定：
- 若征地行为严重违反了《土地管理法》《国有土地上房屋征收与补偿条例》等法律法规的强制性规定，如未依法获得征地审批手续、超越批准范围占用土地等，则基于这种违法征地所签订的补偿协议，通常会因违反法律强制性规定而被认定为无效。例如，拆迁方未取得合法拆迁许可即签订补偿协议，该协议自始无效。
存在欺诈、胁迫情形：
- 若征收方在征地过程中采用欺诈手段隐瞒征地违法事实，或通过胁迫方式迫使被征收人签订协议，根据《民法典》第一百四十八条和第一百五十条，受欺诈或胁迫方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。被撤销的协议自始没有法律约束力。例如，拆迁方虚构国家重点工程建设需求，实则用于商业开发，欺骗被拆迁人签订协议，该协议可因欺诈而被撤销。
恶意串通，损害国家、集体或第三人利益：
- 拆迁方与部分被拆迁人恶意串通，签订损害国家、集体或其他被拆迁人利益的协议，此类协议无效。例如，拆迁方给予少数被拆迁人不合理高额补偿，损害其他被拆迁人利益，该协议因恶意串通而无效。
以合法形式掩盖非法目的：
- 拆迁方通过签订形式上合法的协议来掩盖其违法强拆、非法获取土地等非法目的，此类协议无效。例如，拆迁方签订看似正常的补偿协议，实则为了绕过法定拆迁审批程序，该协议因以合法形式掩盖非法目的而无效。
二、协议可能可撤销的情形
因重大误解订立：
- 被拆迁人对协议重要内容（如补偿金额、安置方式）存在重大误解而签订协议，有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。例如，被拆迁人误解拆迁政策，以为补偿已包含所有项目，实则未涵盖某些重要补偿项目，该协议可因重大误解而被撤销。
显失公平：
- 协议订立时明显违反公平、等价有偿原则，一方利用优势或对方缺乏经验，致使双方权利义务明显失衡，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销协议。例如，拆迁方利用被拆迁人缺乏拆迁知识，签订极低补偿协议，与市场价值相差悬殊，该协议可因显失公平而被撤销。
三、协议可能有效的情形
意思表示真实且不违反法律强制性规定：
- 若拆迁方与被拆迁方在签订协议时，双方均出于真实意愿，无欺诈、胁迫等不正当手段，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则即使后续拆迁行为被认定为违法，该协议仍可能有效。例如，双方就补偿事宜充分协商后自愿签订协议，但因拆迁程序瑕疵导致拆迁行为违法，不影响协议效力。
当事人事后追认：
- 如协议签订过程中存在轻微瑕疵，但当事人在事后通过实际行为（如接受补偿款）对协议进行了追认，表明愿意继续履行，则该协议同样有效。例如，协议签订时拆迁程序存在轻微违法，但被拆迁人事后接受了补偿款，视为对协议的追认，该协议有效。
四、法律建议与救济途径
- 面对违法征地及协议效力问题，被征收人应尽快收集相关证据，如征地公告、补偿协议、沟通记录等，以便在后续的法律程序中维护自身权益。
- 可考虑通过行政复议、行政诉讼等途径，请求有权机关对协议效力进行审查和判定。若协议被确认无效或可撤销，被征收人有权要求拆迁方重新协商拆迁补偿事宜，并签订合法的拆迁补偿协议。
- 同时，也可向相关部门举报违法征地行为，以维护社会公共利益和法律秩序。相关部门在接到举报后，应依法进行调查处理，并对违法征地行为进行纠正和处罚。
综上所述，征地拆迁程序违法签的协议效力并非绝对无效，而是需要根据具体情况进行综合判断。在处理此类问题时，应严格遵循法律法规的规定，确保各方权益得到妥善保护。若您面临此类问题，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。