针对您提出的“中标通知书发出后合同签订前有变更怎么办”的问题，这确实是一个在招投标过程中可能遇到的复杂情况。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，中标通知书发出后，虽然它标志着招标人已经确定了中标人，但合同的正式签订还需要双方进一步协商并达成一致。在这个过程中，如果出现了变更，我们需要根据变更的性质和影响来分别处理。
一、变更的性质
非实质性变更：如果变更内容不涉及合同的主要条款，如价格、交货期、质量标准等，且双方能够就这些变更达成一致，那么这些变更通常是可以接受的。在这种情况下，双方可以在合同中明确这些变更，并继续推进合同的签订。
实质性变更：如果变更内容涉及合同的主要条款，或者对合同的履行产生重大影响，那么这就需要特别谨慎处理。因为根据《招标投标法》的相关规定，在确定中标人前，招标人不得与投标人就投标价格、投标方案等实质性内容进行谈判。虽然中标通知书已经发出，但如果双方在合同签订前就实质性内容进行变更，仍然可能涉嫌违规。
二、变更的影响及处理方式
影响中标结果：如果变更内容导致中标结果发生实质性变化，那么中标结果可能无效。在这种情况下，招标人可能需要重新进行招标或选择其他中标人。同时，如果变更是由于中标人的原因导致的，中标人还可能需要承担相应的法律责任。
不影响中标结果：如果变更内容不影响中标结果，但双方仍然希望就某些条款进行变更，那么双方可以协商并签订补充协议。但需要注意的是，补充协议的内容必须合法、合规，且不得违反招标文件和中标通知书中的相关规定。
三、具体操作建议
及时沟通：一旦发现需要变更的情况，双方应及时沟通并明确变更的内容和原因。
评估影响：双方应共同评估变更对合同履行和中标结果的影响，以确定是否需要重新招标或签订补充协议。
遵循法律程序：如果变更涉及实质性内容或影响中标结果，双方应遵循相关法律程序进行处理，如重新招标、报请相关部门批准等。
明确条款：在签订补充协议时，双方应明确变更的条款、生效时间、违约责任等，以确保合同的合法性和有效性。
四、案例参考
以您提供的案例为例，如果中标公司在合同生效前受到禁止参加政府采购活动的处罚，导致无法继续履行合同，那么招标人可以根据招标文件和中标通知书中的相关规定取消其中标资格，并通过递补方式确定其他中标供应商。这充分说明了在合同签订前设置相关约束条件的重要性。
综上所述，中标通知书发出后合同签订前出现变更时，双方应根据变更的性质和影响来分别处理，并遵循相关法律程序进行操作。如有需要，建议咨询专业法律人士以获取更具体的法律建议。