结论概述：在自建房合同因特定原因被认定为无效的情况下，退款问题需根据合同无效的具体原因、双方过错程度以及实际出资情况等多方面因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同无效的原因：

   • 违反法律法规：若自建房合同违反了国家关于土地管理、城乡规划、房屋建设等方面的法律法规，如未经批准擅自建设、超出规划许可范围等，合同可能因此被认定为无效。
   • 意思表示不真实：若合同双方在签订合同时存在欺诈、胁迫等情形，导致一方意思表示不真实，合同也可能被认定为无效。
   • 损害社会公共利益：若合同内容损害了社会公共利益，如违反公序良俗、损害国家利益等，合同同样可能被认定为无效。

2. 退款原则：

   • 过错原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同无效后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。因此，退款问题需根据双方过错程度进行划分。
   • 实际出资情况：在自建房合同中，若双方均有出资，且合同无效非因一方过错导致，退款时应考虑双方的实际出资比例进行分配。若一方未出资或出资较少，且合同无效与其行为有关，则其可能无权要求全额退款或需承担部分损失。

3. 具体情形分析：

   • 若合同因违反法律法规被认定无效：在此情况下，双方可能均存在过错，尤其是如果双方均明知或应知合同内容违法仍签订。退款时，法院可能根据双方过错程度、实际出资情况以及房屋建设现状等因素，判决双方按比例分担损失或返还部分款项。
   • 若合同因意思表示不真实被认定无效：如一方存在欺诈行为，导致另一方在违背真实意思的情况下签订合同，则欺诈方应承担全部责任，全额退还对方出资，并赔偿对方因此遭受的损失。
   • 若合同因损害社会公共利益被认定无效：在此情况下，双方可能均需承担一定责任，退款问题需根据具体情况判断。若一方行为明显恶劣，如故意违反公序良俗，则其可能需承担更大责任。

4. 建议与行动：

   • 收集证据：在处理此类纠纷时，双方应积极收集与合同签订、履行相关的证据，如出资凭证、建设许可、规划文件等，以证明自己的主张。
   • 协商解决：在诉讼前，双方可尝试通过协商方式解决纠纷，以节省时间和成本。协商时，可邀请第三方调解机构或律师参与，以确保协商结果的公平性和合法性。
   • 诉讼途径：若协商无果，双方可向法院提起诉讼，由法院根据事实和法律作出判决。在诉讼过程中，双方应积极配合法院调查取证工作，并遵守法庭纪律和诉讼程序。

总结与启示：自建房合同无效后的退款问题涉及多方面因素，需根据具体情况综合判断。在处理此类纠纷时，双方应保持冷静和理性，积极收集证据并寻求专业法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。