若您已申请了协议书，但另一方不同意，您可以考虑以下几种处理方式：

1. 进一步沟通协商：

   • 法律背景：在合同纠纷中，双方协商是解决争议的首选方式，它有助于维护双方的关系，并可能达成双方都能接受的解决方案。
   • 建议：您可以尝试与另一方进行更深入的沟通，了解其不同意的具体原因，并探讨是否有折中的方案或补偿措施可以达成共识。在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化的争执。

2. 寻求第三方调解：

   • 法律背景：如果双方直接协商无果，可以考虑寻求第三方的调解。调解是一种非诉讼的争议解决方式，由中立的第三方协助双方达成和解。
   • 建议：您可以联系当地的调解机构或行业协会，了解调解的具体流程和费用，并邀请另一方共同参与调解。调解过程中，调解员会协助双方梳理争议焦点，提出解决方案，并促使双方达成和解协议。

3. 考虑法律途径：

   • 法律背景：如果协商和调解均无法解决问题，您可以考虑通过法律途径解决争议。这包括提起诉讼或申请仲裁，具体取决于协议书中是否约定了仲裁条款以及当地的法律规定。
   • 建议：
     • 诉讼：如果您决定提起诉讼，需要准备充分的证据材料，包括协议书、沟通记录、相关凭证等，以证明您的权益。同时，您需要了解诉讼的程序和费用，并考虑是否需要聘请律师代理诉讼。
     • 仲裁：如果协议书中约定了仲裁条款，或者双方同意通过仲裁解决争议，您可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁程序相对灵活，且裁决具有法律效力。

4. 评估协议书的法律效力：

   • 法律背景：在采取任何行动之前，您需要评估协议书的法律效力。如果协议书存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫、显失公平等），则另一方不同意可能有其合理依据。
   • 建议：您可以咨询专业律师，对协议书的法律效力进行评估。如果协议书确实存在无效或可撤销的情形，您可能需要考虑重新协商或采取其他法律措施来维护自己的权益。

在处理此类纠纷时，您需要注意以下几点：

• 保留证据：确保您保存了所有与协议书相关的证据材料，包括沟通记录、付款凭证、协议书原件等。这些证据将在后续的协商、调解或诉讼中发挥重要作用。
• 了解法律程序：在采取法律途径之前，了解相关的法律程序和费用，以便做出明智的决策。
• 保持冷静和理性：在处理纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免情绪化的争执和过激行为，以免加剧矛盾并影响问题的解决。

若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。