结论：事业单位副科长退休三年后挂靠监理公司做监理项目，是否违纪违法需分情况讨论，主要取决于挂靠行为是否违反了事业单位的相关规定、国家法律法规以及监理行业的规范。

1. 违反事业单位相关规定的情况

• 规定内容：许多事业单位对于退休人员在外兼职或挂靠有明确的规定，这些规定可能涉及利益冲突、兼职时间、兼职收入等多个方面。如果退休副科长所在的事业单位有明确规定禁止退休人员在外挂靠或兼职，那么其挂靠监理公司的行为就违反了事业单位的内部规定。
• 后果：违反事业单位规定可能面临内部纪律处分，如警告、记过、降级等，具体处分措施依据事业单位的规章制度而定。

2. 违反国家法律法规的情况

• 法律法规：
  • 《中华人民共和国公务员法》（虽针对公务员，但事业单位人员管理常参照此法）：该法规定了公务员退休后的从业限制，如不得从事与原工作业务直接相关的营利性活动等。若事业单位副科长退休后挂靠的监理项目与其原工作业务直接相关，且未按规定报批或存在利益输送等情形，则可能违反此法。
  • 《中华人民共和国招标投标法》及相关监理行业规定：监理行业有其特定的资质要求和从业规范。如果退休副科长以挂靠方式获取监理项目，而实际上并未亲自参与监理工作，或者挂靠的公司不具备相应的监理资质，那么这种行为可能违反了招标投标法和监理行业的规定。
• 后果：违反国家法律法规可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等；情节严重的，还可能构成犯罪，如受贿罪、滥用职权罪等，需承担刑事责任。

3. 违反监理行业规范的情况

• 行业规范：监理行业有其严格的职业道德和从业规范，要求监理人员必须亲自到场、认真履行职责等。如果退休副科长挂靠监理公司后，并未实际参与监理工作，或者挂靠行为导致了监理质量的下降，那么这种行为就违反了监理行业的规范。
• 后果：违反监理行业规范可能面临行业内的处罚，如吊销监理资质、禁止从业等；同时，还可能因监理失职而承担民事赔偿责任。

建议：

• 了解规定：退休副科长在挂靠监理公司前，应首先了解所在事业单位的相关规定以及国家法律法规和监理行业的规范，确保自己的行为合法合规。
• 谨慎选择：如果决定挂靠监理公司，应选择具有合法资质、信誉良好的公司，并确保自己能够亲自参与监理工作，认真履行职责。
• 咨询专业：如有任何疑问或不确定之处，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律意见。

总之，事业单位副科长退休三年后挂靠监理公司做监理项目是否违纪违法，需根据具体情况进行判断。在做出决定前，务必充分了解相关规定和法律法规，确保自己的行为合法合规。