结论：年假应当算全勤，员工在依法休年假期间，应享受与正常工作期间相同的工资收入及福利待遇，包括全勤奖。
法律依据与解析
年假的带薪性质：
- 根据《职工带薪年休假条例》第二条，机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假，职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这表明年假是带薪的，应视为正常工作时间的一部分。
全勤的定义与年假的关系：
- 全勤通常指员工在规定出勤时间内按时到岗，未出现迟到、早退、旷工等违反考勤纪律的情况。年假作为员工的法定权利，不属于缺勤或旷工范畴，因此休年假并不违反全勤的定义。
年假与全勤奖的发放：
- 全勤奖是企业为激励员工出满勤、保证工作正常开展而设立的奖励机制。由于年假是带薪的，且不属于无故缺勤，因此员工在休年假期间应被视为全勤，不应影响全勤奖的发放。用人单位若以员工休年假为由扣减全勤奖，可能构成对员工合法权益的侵害。
特殊情况与应对建议
用人单位规章制度的影响：
- 虽然从法律和普遍认知角度看，年假应计入全勤，但实际操作中需考虑用人单位的规章制度或劳动合同中的特殊约定。如果用人单位依法制定的规章制度中明确规定年休假不计入全勤，并且该规章制度的制定程序合法，内容不违反法律法规的强制性规定，那么在该单位内部可能会按照此规定执行。然而，这种特殊规定相对较少，且可能面临法律风险，因为它可能与年休假制度保障劳动者权益的初衷相悖。
应对建议：
- 查看公司规定：员工在休年假前，应查阅公司关于全勤和年假的具体规定，确保自身权益不受侵害。
- 沟通协商：若公司规定与法律法规相悖，员工可与公司进行沟通协商，要求修正不合理规定。
- 法律维权：在必要时，员工可通过劳动仲裁等法律途径维护自身合法权益，确保休年假不影响全勤认定及相应福利待遇的发放。
实际案例与启示
- 在实际案例中，法院通常会支持员工在休年假期间应享受与正常工作期间相同的待遇和福利，包括全勤奖等奖励制度。用人单位应遵守劳动法规定，保障员工的合法权益不受侵害。如遇到因休年假而被扣除全勤奖的情况，员工应依法维权，通过沟通协商、投诉举报或劳动仲裁等途径保护自己的合法权益。
综上所述，年假应当算全勤，员工在休年假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入及福利待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。