综合工时制下，病假通常不计入工时，但在某些特殊情况下可能会计入。以下是对这一问题的详细分析：
一、病假通常不计入综合工时制的工时
法律层面考量：
- 虽然相关法律法规并未直接规定综合工时制下病假必须计入或不计入工时，但综合工时制的核心是围绕劳动者实际付出的劳动量进行核算。病假是员工因健康原因无法工作的特殊时期，因此，从逻辑上讲，病假时间不应计入实际工作工时。
病假性质分析：
- 病假并非员工为了完成工作任务而投入的有效工作时间，而是他们因健康原因无法履行工作职责的特定阶段。在计算综合工时制的总工时时，将病假时间排除在外是合理的，也是符合病假性质的。
二、特殊情况下的处理
尽管病假通常不计入工时，但在某些特殊情况下，用人单位可能会根据具体情况作出不同处理：
支付正常工资的病假：
- 如果用人单位按照正常出勤工资标准支付劳动者病假期间的工资，那么出于工资与工作时间对应的考虑，用人单位可能会将这部分病假时间计入工时。这样做有助于准确计算整个综合计算周期内的工作时长是否符合法定标准。但这种情况并非普遍现象，需根据用人单位的具体规定和劳动合同来确定。
劳动合同和规章制度的约定：
- 用人单位与劳动者签订的劳动合同以及单位内部的规章制度可以对综合工时制下病假是否计入工时进行约定或规定。如果劳动合同或规章制度中明确规定了病假计入或不计入工时的具体条款，并且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照约定或规定执行。
三、实际操作建议
参考当地法律法规：
- 在实际操作中，建议用人单位和员工参考当地的相关法律法规，以确保对综合工时制下病假是否计入工时有准确的理解和应用。不同地区的法律法规可能存在差异，因此需结合当地情况进行具体分析。
遵循企业规章制度：
- 用人单位在制定相关规章制度时，应遵循法定程序，确保规章制度的合法性和有效性。同时，规章制度中应明确规定综合工时制下病假是否计入工时，以避免产生纠纷。
及时沟通协商：
- 如果员工对病假是否计入工时有疑问或异议，建议及时与用人单位进行沟通协商。通过沟通协商，可以明确双方的权利和义务，避免不必要的纠纷和误解。
总结来说，综合工时制下病假通常不计入工时，但在支付正常工资的病假或劳动合同、规章制度有明确约定的情况下可能会计入。因此，在具体应用中需结合实际情况和相关法律法规进行综合判断和处理。如果您对这一问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。