公司在有债务纠纷的情况下，是可以依法变更法定代表人的，但这一过程需严格遵循法定程序，并确保不损害债权人的利益。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律依据与可行性

1. 《中华人民共和国公司法》：该法明确规定，公司有权依照法律和公司章程的规定更换法定代表人。法律并未禁止公司在存在债务纠纷时进行法定代表人的变更。

2. 《中华人民共和国民法典》：此法强调，法人（包括公司）以其全部财产独立承担民事责任。这意味着，公司的债务不会因法定代表人的变更而转移或消灭，始终由公司自身承担。

二、债务承担问题

1. 公司债务的独立性：公司的债务是公司自身的法律责任，与法定代表人个人无关。无论法定代表人如何变更，公司的债务都需由公司以其全部财产来偿还。

2. 特殊情况下的个人责任：如果法定代表人在代表公司进行民事活动时存在恶意串通、滥用职权、虚假出资、抽逃出资等损害公司债权人利益的行为，那么该法定代表人可能需要对公司债务承担相应的民事赔偿责任。但这种责任是基于其个人的过错行为，而非仅因其作为法定代表人的身份。

三、变更程序与注意事项

1. 召开股东会或股东大会：按照公司章程的规定，召开会议并作出变更法定代表人的决议。该决议通常需要经代表三分之二以上表决权的股东通过（具体比例根据公司章程确定）。

2. 准备并提交申请材料：包括法定代表人登记表、股东会决议、新法定代表人的任职文件及身份证明等，向工商行政管理部门申请办理变更登记。

3. 及时通知债权人：为避免潜在纠纷，公司应在变更过程中确保相关信息的透明度，并及时通知债权人。这有助于维护债权人的知情权，减少因信息不对称而引发的法律风险。

4. 完成变更登记：自变更决议或决定作出之日起30日内，向公司登记机关申请变更登记。未经变更登记，公司不得擅自改变登记事项，否则可能面临法律处罚。

四、特殊情况的法律处理

1. 公司被起诉期间：变更法定代表人对于公司作为被告参加诉讼没有影响。只要新任法定代表人不存在过错，起诉公司与法定代表人并无直接关联。

2. 新法人代表的责任：新法人代表在接任后，需对公司的债务负责。这意味着新法人代表需要了解公司的财务状况，并承担起管理公司和偿还债务的责任。如果因新法人代表的不当行为导致公司无法履行债务，新法人代表可能需要承担法律责任。

五、建议与总结

1. 咨询专业律师：鉴于法人变更涉及的法律程序和潜在风险，建议公司在变更前咨询专业律师或机构。他们可以提供专业的法律意见和指导，帮助公司确保变更过程的合规性，并降低潜在的法律风险。

2. 确保程序合法：公司在变更法定代表人时，必须严格遵守相关法律法规和程序要求。任何违规操作都可能导致变更无效，甚至引发法律纠纷。

3. 维护债权人利益：在变更过程中，公司应充分考虑债权人的利益，确保不损害其合法权益。这有助于维护公司的信誉和形象，为公司的长期发展奠定基础。

综上所述，公司在有债务纠纷的情况下可以依法变更法定代表人，但必须遵守相关法律法规和程序要求，并充分考虑债权人的利益。为确保变更过程的顺利进行和降低法律风险，建议公司在变更前咨询专业律师或机构。