公司在有案件纠纷的情况下，是可以变更法人的。法人变更属于公司自治范畴，法律并未禁止在纠纷期间变更法人。不过，在操作时需遵循一定的程序和规定。

1. 变更程序：

   • 根据公司章程，由股东会或董事会作出变更法人的决议。
   • 准备好法定代表人签署的申请书、变更决议等必要文件。
   • 向原登记机关申请变更登记，并如实提交相关材料。

2. 注意事项：

   • 即便法人变更，公司的债权债务仍由公司承担，不会因法人变更而转移。
   • 若纠纷涉及原法定代表人个人责任，仍需依法追究其个人责任。
   • 在向工商行政管理部门申请变更时，应确保提交的材料真实、完整，符合法定要求。

3. 特殊情况：

   • 若官司涉及到公司的重大债务纠纷等情况，可能会对变更法人产生一定影响。例如，债权人可能会对变更行为提出异议，要求在债务处理完毕后再进行变更。

综上所述，公司在有案件纠纷时是可以变更法人的，但需遵循法定程序，并考虑到可能涉及的相关问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。