结论：公司在有诉讼案件的情况下，是可以变更法人的，但这一变更必须遵循法定程序，且不能损害诉讼的公正性和效率，同时需考虑案件性质、法院裁定及法律规定等因素。
一、法律原则与规定
公司法人独立性：公司作为独立的法人实体，其内部管理和经营决策（包括法人的变更）原则上不受外部诉讼的直接影响。根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，法人的变更是公司的基本权利之一，除非存在法律明确禁止的情形。
诉讼中的限制条件：虽然公司有权在诉讼期间变更法人，但若诉讼涉及公司控制权争议、股权纠纷或法定代表人责任等核心问题，法院可能要求维持现状以保障当事人权益。例如，在股权转让纠纷中，法院可能冻结相关股权直至判决生效；在法定代表人损害公司利益时，法院可能限制其职权行使。
二、变更条件与流程
内部决策：公司更换法定代表人需首先通过股东会、股东大会或董事会的决议（具体依据公司章程规定），确保变更行为符合公司内部治理结构和章程规定。
准备材料：变更法人需准备一系列文件，包括但不限于变更登记申请书、股东会决议、公司营业执照副本、新法定代表人的身份证明及任职文件等。
申请变更：将准备好的材料提交至公司登记机关（通常为当地市场监督管理局），按照法定程序申请办理变更登记。
合规性审查：在变更过程中，应严格遵守相关法律法规，确保所有手续的合法性和合规性，避免因程序瑕疵引发法律风险。
三、变更法人的法律影响
责任连续性：公司作为一个独立的法律实体，其对外承担的法律责任不会因法人的变更而改变。即，变更后的公司仍需对诉讼所涉及的债务、纠纷等法律责任负责。
诉讼进程不受影响：法人变更并不影响公司被起诉的诉讼进程，相关案件将继续按照法定程序进行审理。
特殊情况的法律审查：若法人变更存在恶意逃避债务、损害债权人利益等不正当目的，相关变更行为可能会面临法律审查和质疑，甚至可能被撤销。
四、实践中的考虑与建议
及时向法院报备：为确保诉讼的顺利进行，当公司决定在诉讼期间更换法定代表人时，应及时向法院提交相关的变更材料和说明。法院将据此更新诉讼材料，并确保诉讼程序不受影响地继续进行。
避免恶意变更：公司应确保法人变更的合法性和正当性，避免为了恶意逃避债务或故意影响诉讼进程而进行变更。否则，法院可能会对该变更行为进行严格的审查和必要的干预。
考虑案件性质：在决定是否变更法人时，公司应充分考虑案件的性质和可能的影响。例如，在涉及公司控制权争议或股权纠纷的案件中，法人变更可能会引发更多的法律争议和不确定性。
总结与建议：公司在有诉讼案件的情况下可以变更法人，但必须遵循法定程序，并考虑案件性质、法院裁定及法律规定等因素。在进行法人变更时，公司应确保变更行为的合法性和正当性，并及时向法院报备变更情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。