公司在有司法案件期间可以变更法人，但具体能否变更需根据案件性质、司法程序的要求以及公司内部决策程序来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、法律规定与原则
- 无明确禁止性规定：我国《公司法》并未明确禁止在公司涉及司法案件期间进行法定代表人的变更。变更法人属于公司内部治理事项，原则上应遵循《公司法》及公司章程规定的程序进行。
- 合法合规性原则：尽管法律未明确禁止，但变更行为必须确保合法合规，不得影响司法案件的处理，也不得损害债权人或其他相关方的合法权益。
二、具体情形分析
公司作为犯罪主体（刑事案件）：
- 若公司本身作为犯罪主体被追究刑事责任（如单位犯罪），则变更法定代表人的请求通常不会被允许，因为这与刑事诉讼活动存在直接关联。此时，相关机关会对公司的经营活动及法定代表人职责进行调查和审查，变更法人可能影响案件侦查、证据收集或损害债权人利益等。
个别员工或管理层涉嫌犯罪（刑事案件）：
- 若仅是公司个别员工或管理层涉嫌犯罪，而公司本身并未被卷入刑事案件中，理论上可以考虑变更法定代表人。但需遵循公司内部决策程序的合规性，并获得相关监管机构的批准（如司法机关无异议）。同时，新的法定代表人需满足资格条件，并承担相应责任和义务。
公司涉及民事案件：
- 在民事案件中，公司变更法人通常不受直接限制，但需履行相应的内部决策程序和向登记机关申请变更登记。同时，应及时通知与公司有业务往来的合作伙伴、债权人等，避免产生不必要的纠纷。在涉及诉讼的情况下，还需向法院提交变更法定代表人的书面说明及新的法定代表人身份信息，以确保诉讼程序的顺利进行。
特殊情形下的限制：
- 失信被执行人名单中的公司：根据相关规定，被列入失信被执行人名单的企业法定代表人可能发生变更时，需经过法院审查同意。这是为了防止企业通过变更法人来规避执行措施。
三、变更程序与注意事项
内部决策程序：
- 通常需要召开股东会或股东大会，经代表三分之二以上表决权的股东通过相关决议。这是变更法人的前提和基础。
准备法定文件：
- 包括变更登记申请书、股东会决议、新法定代表人的身份证明等。这些文件是办理变更登记手续的必要材料。
向登记机关申请变更登记：
- 前往工商行政管理部门办理变更登记手续，提交相关材料并缴纳相关费用。完成变更登记后，公司即取得新的法人资格。
通知相关方：
- 应及时通知与公司有业务往来的合作伙伴、债权人等，避免产生不必要的纠纷。在涉及诉讼的情况下，还需向法院提交变更法定代表人的书面说明及新的法定代表人身份信息。
考虑潜在风险：
- 逃避责任的风险：若公司为逃避法律责任而恶意变更法人，可能面临法律风险，如被追究原法人的责任或受到行政处罚。
- 影响诉讼进程：在诉讼过程中变更法人，可能导致法院送达困难，影响诉讼效率。同时，新法人可能需要承担原公司的部分义务和责任，增加其法律风险。
四、结论与建议
公司在有司法案件期间变更法人需谨慎对待。在遵循法律规定和原则的前提下，应充分考虑司法程序的要求和影响，确保变更行为合法合规且不影响司法案件的处理。若公司确实需要变更法人，建议提前咨询专业律师（即向我咨询）的意见和建议，以确保变更行为的合法性和合规性。同时，公司应保持诚信和守法经营的原则，以维护自身的声誉和长期发展。