公司法人有案件时，是否可以变更法人需根据具体情况判断，但法律并未明确禁止在有案件期间变更法人。以下从不同案件类型及变更程序等角度进行详细分析：

一、不同案件类型下的变更可能性

1. 刑事案件

   • 公司作为犯罪主体：若公司本身作为犯罪主体被追究刑事责任（如单位犯罪），变更法人的请求通常不会被允许。因为此时相关机关会对公司的经营活动及法定代表人职责进行调查和审查，变更法人可能影响案件处理。
   • 个别员工或管理层涉嫌犯罪：若仅是公司个别员工或管理层涉嫌犯罪，而公司本身并未被卷入刑事案件中，理论上可以考虑变更法定代表人。但需遵循公司内部决策程序的合规性，并获得相关监管机构的批准（如有需要）。同时，新的法定代表人需满足资格条件，并承担相应责任和义务。
   • 司法限制：司法机关在办理刑事案件过程中，可能会根据公司的具体情况和案件需要，对公司的某些行为进行限制，包括法人变更。若司法机关认为变更法人可能影响案件侦查、证据收集或损害债权人利益等，可能会要求工商部门暂停办理相关变更手续。

2. 民事案件

   • 一般民事案件：公司在有民事案件期间可以变更法人。法律并未禁止在有民事案件期间变更法人，但需注意履行内部决策程序、向登记机关申请变更登记、通知相关方等程序要求。
   • 特殊情形下的限制：若公司被列入失信被执行人名单，根据相关规定，企业法定代表人变更时需经过法院审查同意，以防止企业通过变更法人来规避执行措施。

二、变更法人的程序及注意事项

1. 内部决策程序

   • 通常需要召开股东会或股东大会，按照公司章程规定的表决比例通过变更法人的决议。决议内容应明确同意变更法人，并指定新法人的相关信息。

2. 准备并提交材料

   • 包括变更登记申请书、股东会决议、修改后的公司章程（如有）、原法人的免职证明、新法人的任职证明及身份证明等。确保所有材料真实、完整且符合法定要求。

3. 提交审核与登记

   • 将准备好的材料提交至当地工商登记机关进行审核。如材料齐全、符合法定形式，登记机关将办理变更登记，并颁发新的营业执照。

4. 通知相关方及后续手续

   • 完成工商变更登记后，还需及时到税务、银行等部门办理相关信息的变更手续，如税务登记变更、银行账户名称更新等。同时，应及时通知与公司有业务往来的合作伙伴、债权人等，避免产生不必要的纠纷。在涉及诉讼的情况下，还需向法院提交变更法定代表人的书面说明及新的法定代表人身份信息，以确保诉讼程序的顺利进行。

三、变更法人的法律后果及风险提示

1. 权利义务承继

   • 法人变更后，公司的所有权利和义务将由新的法人承继，包括但不限于合同关系、债权债务等。新法人需承担原公司的部分义务和责任，增加其法律风险。

2. 逃避责任的风险

   • 若公司为逃避法律责任而恶意变更法人，可能面临法律风险，如被追究原法人的责任或受到行政处罚。因此，变更法人应基于合法合规的目的，而非逃避责任。

3. 影响诉讼进程

   • 在诉讼过程中变更法人，可能导致法院送达困难，影响诉讼效率。因此，在变更法人前应充分考虑诉讼进程的影响，并采取相应措施确保诉讼程序的顺利进行。

总结与建议：公司在有案件期间是否可以变更法人需根据具体情况判断。在变更前，应充分了解相关法律规定和程序要求，确保变更行为的合法性和合规性。同时，应咨询专业人士（即我）的意见和建议，以规避潜在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。