结论：没有甲乙双方签字盖章的拆迁补偿协议书，法院在特定情况下仍然可能立案，但能否立案并最终获得法院支持，取决于多种因素。
一、法院立案的基本条件
法院立案主要审查的是原告的起诉是否符合法律规定的条件，包括但不限于：
- 原告是与本案有直接利害关系的公民、法人或其他组织：在拆迁补偿协议纠纷中，通常指被拆迁人或拆迁人。
- 有明确的被告：即拆迁补偿协议中的另一方当事人。
- 有具体的诉讼请求和事实、理由：原告需要明确其诉讼请求，如要求确认协议无效、要求支付补偿款等，并提供相应的事实和理由。
- 属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖：拆迁补偿协议纠纷通常属于民事诉讼范围，且应向有管辖权的人民法院提起诉讼。
二、拆迁补偿协议书未签字盖章对立案的影响
协议书的法律效力：
- 拆迁补偿协议书作为双方意思表示的载体，通常需要双方签字盖章以确认其法律效力。若协议书未经双方签字盖章，其法律效力可能受到质疑。
- 然而，即使协议书未签字盖章，如果双方已经实际履行了协议内容（如拆迁人已经支付了补偿款，被拆迁人已经腾退了房屋），且双方对此无异议，那么该协议书仍可能被视为有效。
对立案的影响：
- 立案阶段：法院在立案阶段主要审查起诉是否符合法定条件，而不直接对协议书的法律效力进行实质性审查。因此，即使协议书未签字盖章，只要原告能提供其他证据证明其与被告之间存在拆迁补偿纠纷，且符合立案条件，法院仍可能立案。
- 审理阶段：在案件审理阶段，法院将对协议书的法律效力进行实质性审查。如果协议书未签字盖章且双方对此存在争议，法院将根据相关法律法规和案件事实，判断协议书是否有效，并据此作出判决。
三、建议与注意事项
- 收集证据：如果拆迁补偿协议书未签字盖章，原告应尽可能收集其他证据证明其与被告之间存在拆迁补偿关系，如拆迁公告、补偿方案、支付凭证、腾退房屋证明等。
- 咨询专业律师：由于拆迁补偿协议纠纷涉及复杂的法律关系和事实认定，建议原告在提起诉讼前咨询专业律师，以评估案件胜诉的可能性并制定合适的诉讼策略。
- 注意诉讼时效：根据相关法律法规的规定，拆迁补偿纠纷可能受到诉讼时效的限制。因此，原告应在法定期限内提起诉讼，以免丧失胜诉权。
最后，如果您在拆迁补偿协议方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和帮助。