罚工资百分之十五，通常是基于员工的应发工资总额来计算，而非仅指底薪。不过，具体是否包括底薪以及其他工资组成部分，还需根据公司的规章制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 应发工资总额的概念：

   • 应发工资总额通常包括底薪、奖金、津贴、补贴等所有应发放给员工的工资性收入。当公司决定对员工进行罚款时，如果罚款比例是基于应发工资总额，那么罚款金额将包括底薪在内的一部分。

2. 公司规章制度与劳动合同：

   • 公司规章制度和劳动合同是确定罚款基数的重要依据。如果规章制度或劳动合同中明确规定了罚款是基于应发工资总额，那么员工在接受罚款时，应理解并接受这一计算方式。
   • 如果规章制度或劳动合同中未明确规定罚款基数，或者规定不明确，那么公司应与员工进行协商，以确定合理的罚款基数。在协商无果的情况下，可能需要依据相关法律法规或劳动争议调解仲裁机构的裁决来确定。

3. 相关法律法规：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，公司对员工进行罚款时，应确保罚款的合法性和合理性。罚款金额不应超过员工当月工资的百分之二十，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 此外，公司罚款应基于员工违反规章制度或劳动合同的具体行为，且罚款应与员工行为的严重程度相适应。公司不得随意对员工进行罚款，更不得将罚款作为变相克扣工资的手段。

4. 实际操作建议：

   • 对于员工而言，如果公司决定对其进行罚款，员工应首先了解罚款的依据、基数和金额是否合理。如果认为罚款不合理或存在争议，员工可以与公司进行沟通协商，或者向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁。
   • 对于公司而言，在制定规章制度和劳动合同时，应明确规定罚款的基数、比例和条件等事项，以避免因罚款问题而引发的劳动争议。同时，公司在对员工进行罚款时，应确保罚款的合法性和合理性，并遵循相关法律法规的规定。

举例说明：假设某员工的应发工资总额为5000元，其中底薪为3000元，奖金为2000元。如果公司决定对该员工进行罚款，且罚款比例为应发工资总额的百分之十五，那么罚款金额将为750元（5000元 * 15%）。这750元中，自然包括了底薪的一部分。

总结与建议：罚工资百分之十五的计算基数通常是应发工资总额，而非仅指底薪。然而，具体计算方式还需根据公司的规章制度、劳动合同以及相关法律法规来综合判断。如果你对此有疑问或认为公司的罚款行为存在不合理之处，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。