结论：公司因你违反禁烟制度而罚款2000元，这一行为一般不合法。以下从多个角度为你详细分析：

法律角度

1. 罚款权限：

   • 根据《行政处罚法》的相关规定，只有行政机关（如政府、公安机关等）才有权对违法行为进行罚款。公司作为民事主体，并不具备行政处罚权，因此无权对员工进行罚款。

2. 规章制度合法性：

   • 即使公司规章制度中规定了罚款条款，该条款也可能因违反法律强制性规定而无效。因为罚款属于行政处罚范畴，公司无权在规章制度中自行设定。

3. 劳动法保护：

   • 根据《劳动法》和《劳动合同法》的规定，劳动者享有获得劳动报酬、休息休假、劳动安全卫生保护等权利。公司不得以罚款等方式克扣劳动者工资或侵犯劳动者其他合法权益。

实际操作角度

1. 罚款金额合理性：

   • 即使公司有权进行某种形式的处罚（实际上无权罚款），罚款金额也应合理且与违规行为相匹配。2000元的罚款对于违反禁烟制度这一行为来说，显然过高且不合理。

2. 公司内部处理方式：

   • 公司对于员工违反规章制度的行为，应采取合理、合法的处理方式，如警告、记过、解除劳动合同等，而不是通过罚款来惩罚员工。

应对建议

1. 与公司沟通：

   • 你可以首先与公司进行沟通，表达你对罚款行为的不满和异议，要求公司撤销罚款决定。

2. 申请劳动仲裁：

   • 如果公司拒绝撤销罚款决定，你可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，你需要提供相关证据证明公司的罚款行为违法。

3. 寻求法律援助：

   • 如果你对劳动仲裁流程不熟悉或担心自己的权益无法得到充分保障，可以寻求专业律师的法律援助。我可以为你提供专业的法律咨询和代理服务，帮助你维护自己的合法权益。

总结：公司因你违反禁烟制度而罚款2000元的行为一般不合法。你有权与公司沟通、申请劳动仲裁或寻求法律援助来维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。