因身体原因离职被扣工资，一般情况下是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利等。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。除非劳动者因自身原因给用人单位造成经济损失，且用人单位能够证明该损失与劳动者的行为存在直接因果关系，同时按照劳动合同的约定或者依法制定的规章制度的规定，用人单位可以从劳动者的工资中扣除赔偿费用，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
在你因身体原因离职的情况下，如果并未给用人单位造成经济损失，或者用人单位无法证明损失与你的离职存在直接因果关系，那么用人单位扣工资的行为就是违法的。
实际操作角度
查看劳动合同和规章制度：首先，你可以查看自己与用人单位签订的劳动合同以及用人单位的规章制度，看是否有关于离职扣工资的相关规定。如果劳动合同或规章制度中没有明确规定，或者规定与法律法规相抵触，那么用人单位扣工资的行为就是不合法的。
与用人单位协商：如果你认为用人单位扣工资的行为不合法，可以与用人单位进行协商，要求用人单位补发被扣的工资。在协商过程中，你可以提供相关的法律法规作为依据，以增强自己的说服力。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果协商无果，你可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，要求用人单位补发被扣的工资，并可能要求用人单位支付相应的经济补偿或赔偿金。
特殊情况
当然，也存在一些特殊情况。比如，如果你在离职前未按照劳动合同或用人单位的规章制度完成工作交接，导致用人单位遭受损失，用人单位可能会根据相关规定扣除部分工资作为赔偿。但即便如此，扣除的金额也应当合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
建议：如果你因身体原因离职被扣工资，首先保持冷静，收集好相关证据（如劳动合同、工资条、离职证明等），然后与用人单位进行协商。如果协商无果，可以及时寻求法律援助或向相关部门投诉，以维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。