结论：在生效判决书中有两套继承房屋的情况下，你可以选择先主张其中一套房屋的继承。以下从不同角度为你详细分析：

从判决书的执行力角度

生效的判决书具有强制执行力，它明确了当事人之间的权利义务关系。当判决书中确定了你对两套房屋享有继承权时，这就意味着这两套房屋的继承事宜已经通过法律程序得到了确认。你可以根据自己的实际情况和需求，选择先对其中一套房屋行使继承权利，比如办理房屋过户手续等。这是完全符合法律规定的，因为判决书的效力是针对整个继承事项的，并不要求你必须同时对两套房屋都采取行动。

从实际操作流程角度

在实际操作中，先主张一套房屋的继承可能会更加便捷和高效。继承房屋涉及到诸多手续，如办理继承权公证、缴纳相关税费、办理房屋产权过户等。如果同时处理两套房屋的继承，可能会面临时间、精力上的不足，以及手续办理过程中的一些协调问题。而先选择一套房屋进行继承，可以让你有更充足的时间和精力去完成各项手续，确保继承过程的顺利进行。例如，在办理继承权公证时，需要准备一系列的材料，包括被继承人的死亡证明、亲属关系证明、遗嘱（如有）等，先处理一套房屋可以让你更专注于收集和整理这些材料，避免出现遗漏或错误。

从法律风险角度

先主张一套房屋的继承并不会给你带来额外的法律风险。只要你按照法律规定的程序和要求去办理继承手续，就不会因为先继承一套房屋而对另一套房屋的继承产生不利影响。当然，在继承过程中，你需要确保自己的行为符合法律法规的规定，比如如实申报财产、缴纳应纳税费等。如果在这个过程中出现任何问题或纠纷，你可以及时寻求法律帮助，维护自己的合法权益。

建议：

• 在选择先主张哪一套房屋的继承时，你可以考虑房屋的价值、地理位置、使用需求等因素。比如，如果其中一套房屋位于你工作或生活的地方，且更符合你的居住需求，那么你可以优先选择继承这套房屋。
• 在办理继承手续前，建议你先咨询当地的房产管理部门或相关机构，了解具体的办理流程和要求，以便更好地准备相关材料和办理手续。
• 如果在继承过程中遇到任何问题或纠纷，不要慌张，及时向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。