结论：工厂因员工做不良产品而扣钱，其合法性需根据具体情况来判断。若满足一定条件，则合法；否则，可能不合法。
合法扣钱的条件：
有明确且合法的规章制度：
- 工厂必须拥有完善且合法的规章制度，其中应明确规定何种错误行为（如生产不良产品）会导致扣款，以及扣款的具体标准和程序。
- 这些规章制度的制定应经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并向员工公示。这是确保规章制度合法性和有效性的关键步骤。
造成经济损失的赔偿：
- 如果员工因个人原因（如疏忽大意导致生产不良产品）给工厂造成经济损失，工厂有权按照劳动合同的约定要求员工赔偿。
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，赔偿款可从员工工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
员工签字同意：
- 员工在入职时或规章制度修订后，应签字确认已知悉并同意相关扣款规定。这增强了规章制度的合法性和有效性，也是保护员工权益的重要措施。
不合法扣钱的情形：
规章制度不合法或未公示：
- 如果工厂的规章制度未经民主程序制定，或者未向员工公示，即使其中规定了扣款条款，也是不合法的。员工有权拒绝执行此类规章制度。
随意无依据扣钱：
- 工厂不能仅凭“做不良产品”为由随意扣钱，必须有明确的错误行为和相应的扣款依据。否则，扣款行为可能构成违法。
扣款金额超过法定限制：
- 如果工厂扣除员工工资的比例超过了当月工资的20%，或者扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，这种扣款行为是不合法的。员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
员工权益保护：
- 如果员工认为工厂扣钱不合法，首先应与工厂进行协商解决。在协商过程中，员工可以要求工厂提供扣款的依据和计算方式，并核实其合法性。
- 协商不成时，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，员工应提供相关证据（如工资条、扣款通知、规章制度等）来支持自己的主张。
总结与建议：
工厂因员工做不良产品而扣钱，必须建立在合法、合规的基础上。这要求工厂有明确且合法的规章制度，扣款行为需符合相关规定，并且不能损害员工的合法权益。作为员工，应了解自己的权益和维权途径，并在必要时采取适当措施来维护自己的合法权益。如果遇到工厂违法扣钱的情况，建议及时咨询专业律师或向劳动监察部门投诉以获取帮助。