结论前置：针对您提出的“劳动合同约定双休，实际单休，是否可以申请赔偿”的问题，一般情况下，您可以向用人单位主张加班费或要求补休，若用人单位拒绝且未支付相应报酬，您还可以考虑解除劳动合同并主张经济补偿，但直接申请赔偿需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有休息休假的权利，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。若劳动合同中明确约定了双休制度，而实际执行中却变为单休，这明显违反了劳动合同的约定以及劳动法的相关规定。
二、加班费与补休的请求
加班费：在单休的情况下，如果用人单位未安排补休，您有权要求用人单位按照法律规定支付加班费。具体来说，周末加班通常应按照不低于工资的百分之二百支付加班费。
补休：如果用人单位因工作需要不能安排补休，那么应当支付加班费。但如果您更倾向于补休而非加班费，也可以与用人单位协商安排补休。
三、解除劳动合同与经济补偿
解除劳动合同：如果用人单位长期违反劳动合同约定，不安排双休且不支付加班费，您有权以此为由解除劳动合同。
经济补偿：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位违反法律规定或劳动合同约定解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。在您的情况下，如果因用人单位违反双休约定而解除劳动合同，您有权要求用人单位支付相应的经济补偿。经济补偿的计算通常依据您在用人单位的工作年限和工资水平来确定，计算公式为：经济补偿=工作年限×月工资（月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。
四、直接申请赔偿的考量
虽然您有权要求用人单位支付加班费、补休或经济补偿，但“直接申请赔偿”这一表述可能并不完全准确。在劳动法领域，赔偿通常指的是因用人单位违法行为给劳动者造成损失时，用人单位应承担的赔偿责任。而在您的情况下，更直接的是要求用人单位履行劳动合同约定（如支付加班费、安排补休）或承担因违反劳动合同而产生的法律责任（如支付经济补偿）。
五、建议与行动
与用人单位协商：首先，您可以尝试与用人单位沟通，明确表达您的诉求，要求用人单位按照劳动合同约定安排双休或支付相应的加班费。
收集证据：如果协商无果，您需要收集相关证据，如劳动合同、工资单、加班记录等，以证明用人单位违反了劳动合同约定。
申请劳动仲裁：在收集到足够证据后，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求用人单位支付加班费、补休或经济补偿。
寻求法律帮助：如果您在劳动仲裁过程中遇到困难或需要进一步的法律帮助，可以随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。
最后，希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。