针对您提出的“公司经营困难以最低工资标准发放是否合法”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、合法性前提
公司在经营困难时，若考虑以最低工资标准发放工资，必须确保满足以下前提条件，否则可能构成违法行为：
劳动合同或规章制度有明确约定：
- 劳动合同或公司规章制度中应明确规定，在公司经营困难等特定情况下，公司有权调整工资发放标准，且该规定不违反法律法规的强制性规定。
与员工协商一致：
- 公司必须与员工进行充分的协商，就调整工资发放标准达成一致意见。这包括说明降薪的必要性和具体方案，确保员工在了解后表示同意。
履行报备程序（如适用）：
- 部分地区可能要求公司在调整工资发放标准时，向劳动行政部门进行报备。公司应按规定履行报备程序，并确保未遭异议。
不低于当地最低工资标准：
- 无论公司经营状况如何，发放的工资都不得低于当地政府规定的最低工资标准。这是保障员工基本生活需求的底线。
二、合法性分析
在满足上述前提条件的情况下，公司以最低工资标准发放工资是合法的。这是因为：
- 劳动合同约定：若合同中已明确约定在公司经营困难时可以发放最低工资，则此行为符合合同约定，合法有效。
- 协商一致原则：公司与员工就调整工资发放标准达成一致意见，体现了平等自愿、协商一致的原则，符合《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
- 最低工资保障：公司确保发放的工资不低于当地最低工资标准，履行了最低工资保障义务，没有侵害员工的合法权益。
三、不合法情况分析
若公司未满足上述前提条件，以最低工资标准发放工资则可能构成违法行为。具体包括：
- 未履行协商程序：公司未经与员工协商，单方面决定发放最低工资，侵犯了员工的合法权益。
- 恶意降低工资：公司实际上并不存在真实的经营困难，或以经营困难为借口恶意降低员工工资至最低工资标准。
- 低于最低工资标准：公司发放的工资低于当地政府规定的最低工资标准，违反了最低工资保障制度。
四、建议与指导
- 公司方面：在经营困难时，应首先与员工进行充分协商，寻求共识。确保发放的工资不低于当地最低工资标准，并履行报备程序（如适用）。同时，公司应加强内部管理，提高经营效率，以尽快摆脱经营困境。
- 员工方面：应了解自己的合法权益，若发现工资被违法降低，可通过向劳动行政部门投诉、申请劳动仲裁等方式维护自己的权益。
综上所述，公司在经营困难时以最低工资标准发放工资需谨慎操作，确保符合法律规定和劳动合同约定。只有在满足特定条件并履行相应程序的情况下，此行为才是合法的。