政府派工作组主持自然村工作是否合法，需根据具体情况和法律法规来判断，不能一概而论。以下从几个角度进行分析：

1. 政府职责与权限：

   • 政府作为行政机关，有权根据法律法规和政策规定，对辖区内的社会事务进行管理和指导。自然村作为基层社会单元，其工作往往涉及村民自治、公共事务管理等方面。
   • 如果政府派工作组是为了协助自然村处理特定事务（如灾害救援、疫情防控、基础设施建设等），且该行为符合相关法律法规和政策规定，那么这种行为通常是合法的。

2. 村民自治原则：

   • 根据《中华人民共和国村民委员会组织法》等相关法律法规，村民委员会是村民自我管理、自我教育、自我服务的基层群众性自治组织。
   • 政府派工作组主持自然村工作，如果涉及对村民自治事务的直接干预或替代，可能违反村民自治原则。然而，如果工作组是在村民委员会的邀请或同意下，以协助、指导的方式参与工作，且不干涉村民自治事务的决策权，那么这种行为可能是合法的。

3. 具体行为合法性：

   • 政府派工作组的具体行为（如决策、管理、监督等）必须符合法律法规的规定。如果工作组的行为超出了法律法规的授权范围，或者违反了法定程序，那么这种行为可能是违法的。
   • 例如，如果工作组未经村民会议或村民代表会议同意，擅自决定自然村的重要事务（如土地分配、资金使用等），那么这种行为可能构成对村民自治权的侵犯，是违法的。

4. 特殊情况下的合法性：

   • 在某些特殊情况下（如自然灾害、突发事件等），政府可能需要采取紧急措施来保障村民的生命财产安全和社会稳定。在这种情况下，政府派工作组主持自然村工作可能是必要的，且通常被认为是合法的。
   • 但即使在这种情况下，政府的行为也必须符合法律法规的规定，且应当尽可能尊重村民的意愿和自治权。

建议：

• 如果您对政府派工作组主持自然村工作的合法性有疑问，建议首先了解该行为的具体背景、目的和依据。
• 如果您认为该行为可能违反了法律法规或侵犯了村民的自治权，可以向相关部门（如乡镇政府、县级政府等）提出异议或投诉。
• 在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。