寺庙违法占地，在一定条件下是可以主张民事赔偿的。以下从几个角度为您详细分析：
一、违法占地的法律性质
违法占地，通常指的是未经合法审批程序，擅自占用土地进行建设或其他活动的行为。这种行为违反了土地管理法律法规，侵犯了国家对土地的管理权以及可能存在的其他合法土地使用权人的权益。寺庙作为非营利性宗教组织，虽然享有一定的宗教活动自由，但并不意味着其可以无视土地管理法律法规，违法占地。
二、民事赔偿的法律依据
《民法典》相关规定：
- 根据《民法典》的相关规定，因侵权行为造成他人损害的，应当承担侵权责任。违法占地行为，如果侵犯了其他合法土地使用权人的权益，如相邻权、土地使用权等，就可能构成侵权行为，需要承担民事赔偿责任。
土地管理法律法规：
- 土地管理法律法规也规定了违法占地的法律责任，包括行政处罚和民事赔偿等。虽然这些法律法规主要侧重于行政处罚，但并不排除在违法占地行为同时构成侵权时，受害人可以主张民事赔偿。
三、主张民事赔偿的条件
存在侵权行为：
- 需要证明寺庙存在违法占地的行为，且该行为侵犯了您的合法权益。这通常需要通过土地权属证明、现场照片、政府部门的处罚决定等证据来证明。
存在损害后果：
- 需要证明违法占地行为给您造成了实际的损害后果，如土地使用权的丧失、相邻权的受限、财产损失等。这些损害后果应当是具体、可衡量的。
侵权行为与损害后果之间存在因果关系：
- 需要证明违法占地行为与您所遭受的损害后果之间存在直接的因果关系。即如果没有违法占地行为，您就不会遭受这些损害。
四、主张民事赔偿的途径
协商调解：
- 在发现寺庙违法占地后，您可以首先尝试与寺庙进行协商调解，寻求双方都能接受的解决方案。这通常是最快捷、最经济的解决方式。
行政投诉：
- 如果协商调解无果，您可以向当地土地管理部门或相关政府部门进行投诉，要求政府部门对寺庙的违法占地行为进行查处，并恢复土地原状或赔偿损失。
民事诉讼：
- 如果行政投诉也无法解决问题，您可以向人民法院提起民事诉讼，要求寺庙承担民事赔偿责任。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明寺庙的违法占地行为以及您所遭受的损害后果。
五、注意事项
- 在主张民事赔偿的过程中，您需要注意保留好相关证据，如土地权属证明、现场照片、政府部门的处罚决定、协商调解记录等。这些证据将对您主张权利起到至关重要的作用。
- 同时，您也需要了解相关法律法规和诉讼程序，以便更好地维护自己的合法权益。如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。
如果您在寺庙违法占地问题上遇到了困扰或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和解决方案。