结论前置：在劳动仲裁时，公司可能最怕员工提出关于劳动合同、工资支付、加班费、社保缴纳、解除劳动合同合法性及赔偿等方面的关键问题。员工可以从收集证据、了解法律、准备陈述和答辩、模拟庭审等方面进行准备应对。

详细分析：

1. 公司可能最怕员工提出的问题：

   • 劳动合同问题：员工可以询问公司是否与其签订了书面劳动合同，合同内容是否合法合规，特别是关于工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等关键条款。如果公司未签订或合同内容违法，员工有权要求公司承担相应责任。
   • 工资支付问题：员工可以询问公司是否按时足额支付了工资，是否有拖欠、克扣工资的情况。根据《劳动法》和《劳动合同法》，公司必须按时足额支付员工工资，否则将面临法律制裁。
   • 加班费问题：员工可以询问公司是否支付了加班费，加班费的计算方式是否符合法律规定。如果公司未支付或计算方式不合法，员工有权要求公司补发加班费并支付相应的赔偿。
   • 社保缴纳问题：员工可以询问公司是否为其缴纳了社会保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。根据法律规定，公司必须为员工缴纳社会保险，否则将面临罚款等法律责任。
   • 解除劳动合同合法性及赔偿问题：如果公司解除了与员工的劳动合同，员工可以询问解除是否合法，是否有充分的理由和证据支持。如果解除不合法，员工有权要求公司继续履行合同或支付赔偿金。

2. 员工可以如何准备应对：

   • 收集证据：员工应提前收集与劳动争议相关的证据，如劳动合同、工资条、加班记录、社保缴纳记录等。这些证据将有助于证明员工的权益和公司的违法行为。
   • 了解法律：员工应提前了解相关的劳动法律法规，如《劳动法》、《劳动合同法》等。这有助于员工在仲裁过程中更好地维护自己的权益，并指出公司的违法行为。
   • 准备陈述和答辩：员工应提前准备好自己的陈述和答辩材料，明确自己的诉求和理由。在仲裁过程中，员工应清晰、准确地表达自己的观点，并回应公司的答辩。
   • 模拟庭审：如果可能的话，员工可以提前进行模拟庭审，熟悉仲裁流程和规则。这有助于员工在正式庭审时更加从容不迫，更好地应对公司的质询和反驳。

额外建议：

• 在仲裁过程中，员工应保持冷静和理性，避免情绪化的表达和行为。这有助于维护仲裁的公正性和权威性。
• 如果员工对仲裁结果不满意，可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，员工应继续维护自己的权益，并寻求法律援助或咨询专业律师的意见。

最后，劳动仲裁是维护员工权益的重要途径之一。员工在仲裁过程中应充分准备、积极应对，并寻求法律的支持和保护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。