关于店铺被邻居投诉要求搬离，损失由谁承担的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
投诉的合法性与合理性：
- 首先，需要明确邻居投诉的理由是否合法且合理。如果邻居的投诉是基于你店铺的经营活动违反了相关法律法规（如环保、噪音、消防等规定），且这些违规行为确实存在，那么相关部门可能会要求你整改或搬离。在这种情况下，如果因搬离产生的损失是由于你自身的违规行为导致的，那么这部分损失可能需要由你自己承担。
- 反之，如果邻居的投诉缺乏合法依据或合理性，比如仅仅是因为个人喜好或恶意投诉，那么你可以通过法律途径维护自己的权益，要求邻居承担因不当投诉给你造成的损失。
租赁合同中的约定：
- 如果你与房东签订的租赁合同中有关于因外部因素导致搬离时损失承担的条款，那么应首先遵循合同中的约定。合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力。
- 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么就需要根据《民法典》等相关法律法规的规定，结合实际情况来判断损失的承担方。
安全保障义务与侵权责任：
- 从安全保障义务的角度来看，如果你的店铺经营活动没有违反任何法律法规，且已经尽到了合理的安全保障义务（如确保店铺设施安全、遵守消防规定等），那么邻居的投诉可能不构成对你权益的侵害。在这种情况下，如果因邻居的投诉导致你不得不搬离并产生损失，你可以考虑向邻居主张侵权责任，要求其赔偿你的损失。
- 但是，如果邻居的投诉是基于你店铺确实存在的安全隐患或违规行为，且这些隐患或行为对邻居造成了实际损害或潜在威胁，那么邻居的投诉可能具有一定的合理性。在这种情况下，你需要先解决店铺存在的安全隐患或违规行为，然后再根据实际情况与邻居协商损失的承担问题。
实际损失的计算与赔偿：
- 如果最终确定需要由某一方承担损失，那么实际损失的计算将是一个关键问题。这包括但不限于搬离费用、装修损失、停业损失等。在计算损失时，应确保损失的合理性和必要性，避免夸大或虚构损失。
- 赔偿方式也可以根据双方协商或法院判决来确定，可以是一次性赔偿，也可以是分期赔偿或其他方式。
建议：
- 在面对邻居的投诉时，首先保持冷静和理性，不要与邻居发生不必要的冲突。
- 尽快了解投诉的具体内容和理由，评估其合法性和合理性。
- 仔细审查租赁合同中的相关条款，了解自己的权利和义务。
- 如果认为邻居的投诉缺乏合法依据或合理性，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 在整个过程中，保留好相关证据和文件，以便在需要时提供证明。
如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。