结论前置：在分居5年且女方不同意离婚的情况下，男方完全可以通过诉讼离婚的方式来解决。法院在判决时会依据“感情确已破裂”这一法定理由，其中“分居满两年”是认定感情破裂的重要参考因素之一，但并非唯一决定因素。以下是具体的流程和建议：

一、确认法院管辖

要向有管辖权的法院提起离婚诉讼。通常情况下，由被告住所地人民法院管辖；若被告住所地与经常居住地不一致，则由经常居住地人民法院管辖。例如，若女方户口所在地为A地，但在B地连续居住满一年以上，那么男方就需向B地法院提起离婚诉讼。

二、准备诉讼材料

1. 离婚起诉状：需要详细写明原、被告的基本信息，明确诉讼请求（如离婚、财产分割、子女抚养等），并阐述事实与理由，特别是要详细说明分居5年的具体情况。
2. 证据材料：
   • 结婚证：用以证明婚姻关系的存在。
   • 身份证：证明双方的身份信息。
   • 分居证据：这是关键证据，可以包括分居协议、租房合同、居委会或物业的居住证明、涉及分居内容的聊天记录或书信等，用以证明分居事实。
   • 其他相关证据：如果涉及夫妻共同财产，需要提供财产证明；如果涉及子女抚养，需要提供子女的出生证明及生活状况等材料。

三、向法院提起诉讼

将准备好的诉讼材料提交至有管辖权的法院立案庭。法院会对材料进行审查，如果符合立案条件，将予以立案，并向原告出具立案受理通知书及缴费通知。

四、参加庭审

1. 庭前调解：法院会组织双方进行调解，试图达成和解或就离婚事宜达成一致意见。如果调解成功，法院将出具具有法律效力的调解书。
2. 开庭审理：如果调解不成，案件将进入庭审阶段。双方需围绕各自主张进行举证、质证。男方应重点展示分居5年及夫妻感情确已破裂的证据，如分居期间的通信记录、证人证言等。

五、等待判决结果

法院将根据庭审情况和证据，依法作出判决。如果认定夫妻感情确已破裂且调解无效，将判决准予离婚，并对财产分割、子女抚养等问题作出处理。如果认为感情尚未完全破裂，可能判决不准离婚。在这种情况下，男方可以在判决生效后六个月再次提起离婚诉讼。

六、后续事项

• 如果对一审判决不服，可以在收到判决书之日起十五日内向上一级法院提起上诉。
• 在整个诉讼过程中，男方应尽可能收集全面、有力的证据，以证明夫妻感情确实已经破裂。这包括但不限于分居期间的证据、夫妻感情变化的证据等。

重要提示：虽然“分居满两年”可以作为认定夫妻感情确已破裂的参考因素，但法院在判决时会综合考虑多种因素，如双方的感情基础、婚后感情变化、分居的原因及时间等。因此，男方应尽可能提供全面、有力的证据来支持自己的主张。

额外建议：在整个诉讼过程中，男方应保持冷静和理性，遵循法律程序，不要采取过激行为。同时，也可以考虑寻求家人或朋友的支持和陪伴，以减轻心理压力。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。