在租赁合同中明确租户办理营业执照后不再续租时的处理方式，可以这样设计条款：

1. 明确营业执照的办理与注销责任
   在合同中应明确约定，若租户以租赁房屋为注册地址办理了营业执照，则在租赁关系终止（包括合同到期、提前解约等情形）时，租户有义务在一定期限内（如30日）办理营业执照的注销或变更手续，将注册地址迁出租赁房屋。若因租户未及时办理导致出租方遭受损失（如无法再次出租、被行政处罚等），租户应承担全部赔偿责任。

示例条款：
“承租方承诺，若以本合同租赁房屋为注册地址办理了营业执照，则在租赁关系终止后30日内，负责办理该营业执照的注销或变更登记手续，并将注册地址迁出租赁房屋。若因承租方未履行上述义务导致出租方遭受损失的，承租方应承担全部赔偿责任。”

1. 约定违约责任与赔偿范围
   为增强条款的约束力，可进一步明确租户未履行注销或变更义务时的违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿出租方因此产生的直接损失（如租金损失、行政罚款等）及间接损失（如商誉损害等）。违约金金额可根据房屋租金、租赁期限等因素综合确定，建议设置为1-3个月租金的范围内，以起到威慑作用。

示例条款：
“若承租方未在租赁关系终止后30日内完成营业执照的注销或变更登记手续，每逾期一日，应按日租金的200%向出租方支付违约金；逾期超过15日的，出租方有权直接向工商行政管理部门申请注销或变更登记，由此产生的费用由承租方承担。同时，承租方应赔偿出租方因未及时注销或变更营业执照而遭受的全部损失（包括但不限于租金损失、行政罚款、商誉损害等）。”

1. 补充出租方的配合义务
   为避免因出租方不配合导致租户无法办理注销或变更手续，可在合同中约定出租方有义务在合理范围内提供必要的协助（如出具房屋产权证明、配合签署相关文件等）。但需明确，出租方的协助义务以“合理”为限，不包含超出法律或合同约定的额外要求。

示例条款：
“出租方应在承租方办理营业执照注销或变更登记手续时，提供必要的协助（包括但不限于出具房屋产权证明、配合签署相关文件等），但承租方应提前5日书面通知出租方，并说明所需协助的具体内容。出租方的协助义务以不违反法律法规及本合同约定为限。”

1. 考虑设置保证金条款
   为进一步保障出租方权益，可在合同中约定租户需缴纳一定金额的履约保证金（如1-2个月租金），用于担保租户履行营业执照注销或变更义务。若租户未履行义务，出租方有权直接从保证金中扣除相应费用；保证金不足的，租户需在3日内补足。

示例条款：
“承租方应在本合同签订后3日内向出租方支付人民币XX元作为履约保证金。若承租方未在租赁关系终止后30日内完成营业执照的注销或变更登记手续，出租方有权直接从履约保证金中扣除违约金及赔偿款；保证金不足的，承租方应在3日内补足。租赁关系终止且承租方履行完毕全部义务后，出租方应在7日内无息退还剩余保证金。”

总结：
通过上述条款设计，可以全面规范租户办理营业执照后不再续租时的处理方式，明确双方权利义务，降低出租方风险。若您有进一步疑问或需要针对具体场景调整条款，欢迎随时向我咨询。