将两居室改成三室出租是否合法，需分情况讨论，主要取决于是否违反相关法律法规以及是否侵犯他人权益。以下从不同角度为你详细分析：
一、从房屋结构安全角度
如果改造行为破坏了房屋的主体结构，如承重墙、梁柱等，或者改变了房屋原有的设计用途，导致房屋存在安全隐患，那么这种改造行为就是违法的。根据《住宅室内装饰装修管理办法》的相关规定，装修人从事住宅室内装饰装修活动，未经批准，不得有搭建建筑物、构筑物，改变住宅外立面，在非承重外墙上开门、窗，拆改供暖管道和设施，拆改燃气管道和设施等行为。若改造行为涉及这些方面，且未经相关部门批准，就可能面临行政处罚，甚至承担刑事责任（如造成严重后果构成犯罪的）。
举例：如果为了将两居室改成三室，拆除了承重墙，导致房屋结构不稳定，危及居住安全，那么这种改造行为就是违法的。
二、从规划许可角度
如果改造行为改变了房屋的规划用途，比如将原本的居住用房改成了商业用房，或者增加了房屋的建筑面积等，那么这种改造行为也需要经过相关部门的批准。未经批准擅自改变房屋规划用途的，同样可能面临行政处罚。
举例：如果为了将两居室改成三室，在房屋外部搭建了额外的房间，增加了建筑面积，且未经规划部门批准，那么这种改造行为就是违法的。
三、从租赁合同角度
即使改造行为本身不违法，但如果改造后的房屋不符合租赁合同的约定，或者侵犯了其他租户的合法权益（如噪音、采光、通风等受到影响），那么出租人也可能面临违约责任或侵权责任。
举例：如果租赁合同中明确约定了房屋的结构和用途，出租人未经承租人同意擅自改变房屋结构，将两居室改成三室出租，那么出租人就可能构成违约，需要承担违约责任。
四、从消防安全角度
改造后的房屋如果存在消防安全隐患，如疏散通道不畅、消防设施缺失等，那么这种改造行为也是违法的。根据《中华人民共和国消防法》的相关规定，任何单位、个人不得损坏、挪用或者擅自拆除、停用消防设施、器材，不得埋压、圈占、遮挡消火栓或者占用防火间距，不得占用、堵塞、封闭疏散通道、安全出口、消防车通道等。
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