员工是否需要承担法律责任，需根据其具体行为、主观明知程度及在公司中的职责综合判断，可能涉及行政处罚、刑事责任或无责三种情形。具体分析如下：

1. 若员工直接参与假药生产、销售且明知是假药
   根据《刑法》第140条（生产、销售伪劣产品罪）及第141条（生产、销售假药罪），若员工明知公司销售的是假药仍参与生产、运输、仓储、销售等环节，可能构成共同犯罪。例如：

   • 生产线工人明知原料为假仍加工；
     
   • 销售人员向客户隐瞒药品真实性；
     
   • 物流人员协助运输假药。
     处罚：根据销售金额或假药危害程度，可能面临有期徒刑、罚金，甚至终身禁业（如涉及严重危害人体健康的假药）。

2. 若员工未直接参与但知情不报或提供协助
   若员工虽未直接生产、销售，但通过财务、行政等岗位协助公司运营（如伪造文件、隐瞒账目、协助逃避监管），可能被认定为共同犯罪的帮助犯。例如：

   • 财务人员伪造进货凭证掩盖假药来源；
     
   • 质检人员故意出具虚假合格报告。
     处罚：根据作用大小，可能承担主犯或从犯的刑事责任，但量刑通常轻于直接参与者。

3. 若员工完全不知情或被欺骗参与
   若员工能证明自己不知公司销售的是假药（如被虚假宣传误导、未接触核心业务），且未从中获取异常利益，可能不构成犯罪。但需注意：

   • 举证责任：员工需提供证据（如劳动合同、工作记录、同事证言等）证明自己无主观故意；
     
   • 行政责任：即使不构成犯罪，若员工存在过失（如未履行基本审核义务），可能面临行政处罚（如警告、罚款），但实践中对普通员工的行政处罚较少。

建议行动：

• 对员工：若被调查，立即停止一切可能涉及假药的行为，收集证明自己无主观故意的证据（如工作记录、沟通记录），并咨询律师分析具体风险；
  
• 对公司：若已涉嫌犯罪，需尽快停止经营、配合调查，并委托律师处理刑事辩护及民事赔偿，以减轻对员工和公司的整体影响。
  

如有进一步细节（如员工职位、参与环节、假药危害程度等），可向我补充说明，我会结合具体情形为您分析法律风险。