责令候查期间工资待遇的发放需根据具体情况判断，主要分为以下两种情形：

1. 若责令候查属于刑事强制措施中的监视居住，且未被剥夺劳动权利
   根据《刑事诉讼法》第七十六条，被监视居住的犯罪嫌疑人、被告人若未被剥夺人身自由且能正常参与劳动，用人单位应按劳动合同约定支付工资。但若因监视居住导致无法履行原岗位职责（如被限制在特定场所），用人单位可与劳动者协商调整岗位或安排临时性工作，工资标准按调整后的岗位或临时性工作确定。若双方无法协商一致，用人单位可依据《劳动合同法》第四十条第三款解除合同，但需支付经济补偿。

2. 若责令候查属于行政强制措施或纪律处分中的停职调查

   • 行政强制措施：如因涉嫌违法被行政机关责令候查，若未被停职，用人单位应正常发放工资；若被停职，需依据《工资支付暂行规定》第十六条，按不低于当地最低工资标准的80%支付生活费。
     
   • 纪律处分：如公务员、事业单位人员因违纪被责令候查，工资发放需遵循《公务员法》或《事业单位工作人员处分暂行规定》。通常停职期间仅发放基本工资，绩效工资、津贴等暂停发放，待调查结论明确后补发或追缴。

特殊情形补充说明：

• 若责令候查期间劳动者被依法羁押（如刑事拘留），用人单位可中止劳动合同，暂停发放工资，但需保留劳动关系。
  
• 若劳动者被认定无罪或处分被撤销，用人单位应补发停职期间的工资差额，并可能需支付赔偿金（具体依据《国家赔偿法》或内部纪律处分规定）。

建议：

1. 劳动者应保留责令候查的书面通知、劳动合同等证据，以便维权。
   
2. 用人单位需严格依据法律法规或内部规章制度处理工资发放，避免违法风险。
   
3. 若对工资发放有争议，可申请劳动仲裁或向劳动监察部门投诉。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的处理方式。