针对您提出的“门店关闭了，老板还查岗，查到违规怎么办”这一问题，我会从法律角度和实际操作层面为您详细解答。
首先，从法律层面来看，劳动者的休息权是受到法律保护的。即使门店已经关闭，但如果员工在正常工作时间内，且已经连续工作较长时间，出现短暂的休息或生理需求（如上厕所）导致的短暂离岗，并不构成严重违规。以您提供的案例为例，余某在连续工作超过8小时后，因生理性疲劳闭眼休息3分钟，以及因上厕所短暂关闭店门，这些行为并未被法院认定为严重过错，用人单位因此解除劳动合同被判定为违法。
接下来，针对您提到的“老板查岗查到违规”的情况，我建议您采取以下步骤：
了解违规的具体内容：
- 首先，您需要明确老板所指的“违规”具体是什么行为。是违反了公司的规章制度，还是违反了法律法规？
- 如果是违反公司规章制度，您需要查看该规章制度是否合法、合理，以及您是否确实存在违规行为。
评估违规的严重性：
- 不是所有的违规行为都足以导致解除劳动合同。根据劳动法的规定，用人单位解除劳动合同需要有充分的理由和证据。
- 如果您的行为并未对公司的正常运营造成严重影响，或者并未达到公司规章制度中规定的“严重违规”标准，那么用人单位解除劳动合同可能缺乏法律依据。
与老板沟通：
- 在了解违规内容和评估严重性后，您可以与老板进行沟通，解释您的行为背景和原因。
- 如果您的行为确实存在不当之处，您可以表示愿意改正，并请求老板给予机会。
寻求法律援助：
- 如果老板坚持认为您存在严重违规，并威胁要解除劳动合同，您可以寻求法律援助。
- 您可以咨询劳动法律师，了解您的权益和可能的法律途径。
- 如果必要，您可以向劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，或者向法院提起诉讼。
保留证据：
- 在整个过程中，您需要保留好所有相关的证据，如工作记录、聊天记录、监控视频等。
- 这些证据将有助于您在仲裁或诉讼中证明自己的清白或减轻责任。
最后，我想强调的是，劳动者和用人单位之间应该建立和谐、互信的劳动关系。如果门店已经关闭，老板仍然频繁查岗并过度追究员工的“违规”行为，这可能并不利于劳动关系的和谐发展。作为员工，您有权维护自己的合法权益；作为老板，也应该尊重员工的休息权和合法权益，共同营造一个良好的工作环境。