若市场监督管理部门在店铺关门时进行检查，您需要积极配合，并在开门后及时跟进处理相关事宜。具体来说，可以从以下几个角度来分析和处理这种情况：

1. 配合检查程序：

   • 市场监督管理部门有权对经营场所进行监督检查，即使店铺当时处于关门状态，执法人员也可能通过合法程序进入检查，比如持有相关法律文书（如检查通知书、搜查令等）。
   • 如果执法人员要求您开门接受检查，您应当配合。如果因特殊原因无法立即开门，应向执法人员说明情况，并尽快安排开门。

2. 了解检查原因：

   • 执法人员进行检查通常有明确的原因，比如接到投诉、举报，或者是在进行常规的抽查、专项检查等。
   • 您有权向执法人员了解检查的具体原因和目的，这有助于您后续更好地应对和处理。

3. 开门后跟进处理：

   • 如果检查时店铺关门，执法人员可能留下相关通知或要求您在开门后主动联系他们。
   • 您应当在开门后第一时间联系市场监督管理部门，了解检查情况、是否存在违规行为以及需要采取的整改措施。

4. 应对可能的违规行为：

   • 如果检查中发现存在违规行为，市场监督管理部门可能会依法作出行政处罚，如警告、罚款、责令停业整顿等。
   • 您应当认真对待执法人员指出的违规问题，积极整改，并在规定期限内完成整改。如果对处罚有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

5. 保留相关证据：

   • 在整个过程中，您应当保留好与市场监督管理部门沟通的相关证据，如通知、整改要求、处罚决定书等。
   • 这些证据在后续可能的行政复议或行政诉讼中可能会起到重要作用。

6. 日常合规经营：

   • 为了避免类似情况的发生，您应当加强店铺的日常合规管理，确保经营活动符合相关法律法规的要求。
   • 定期进行自查自纠，及时发现并整改潜在的问题，降低被市场监督管理部门检查出违规行为的风险。