若经法定程序确认单位丢失职工档案且未超过诉讼时效，职工可通过以下途径维权：

1. 协商解决
   首先可尝试与单位协商，要求其出具书面说明承认档案丢失事实，并协商补办档案或赔偿方案。若单位配合，可签订书面协议明确补救措施及赔偿金额，避免后续争议。

2. 行政投诉
   向当地劳动监察部门或档案行政管理部门投诉，要求单位履行档案管理义务。根据《档案法》及《劳动合同法》，单位有义务妥善保管职工档案，行政机关可责令其限期整改或给予行政处罚。

3. 劳动仲裁
   若协商及投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张单位因档案丢失导致职工无法享受社保待遇、退休手续受阻等实际损失。需提供劳动关系证明（如劳动合同、工资记录）、档案丢失证明（如单位书面说明或行政机关调查结论）等证据。

4. 民事诉讼
   若仲裁未果或损失金额较大，可直接向法院起诉单位侵权。根据《民法典》第1165条，单位因过错侵害职工民事权益造成损害的，应承担赔偿责任。诉讼中需重点证明：

   • 单位存在档案管理过错（如未按规定移交档案、保管不善）；
     
   • 档案丢失与职工损失的因果关系（如无法补缴社保、无法办理退休）；
     
   • 损失的具体金额（如社保待遇损失、退休金差额等）。

关键注意事项：

• 时效问题：劳动争议仲裁时效为1年，自职工知道或应当知道权利被侵害之日起计算；民事诉讼时效为3年。需确保在时效期内主张权利。
  
• 证据收集：优先固定单位承认档案丢失的书面证据（如回复函、录音），若无直接证据，可通过申请法院调查取证（如调取单位内部档案管理制度、证人证言等）。
  
• 损失计算：社保待遇损失可参考《社会保险法》及地方规定，退休金差额需通过社保部门核算或申请司法鉴定。

建议行动步骤：

1. 立即向单位书面要求补办档案或赔偿，并留存送达证据；
   
2. 同时向劳动监察部门投诉并申请调查；
   
3. 若30日内未解决，尽快申请劳动仲裁；
   
4. 仲裁败诉或对结果不满的，15日内向法院起诉。
   

如有具体证据或损失情况，可进一步向我说明，我会协助分析维权策略。