结论：对方逾期后付款只还了本金并要求开发票，这一要求本身是合法的，但具体是否应开具发票以及发票的开具内容需根据实际情况判断。

分析如下：

1. 发票开具的法定义务：

   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。因此，从法律原则上讲，只要发生了经营业务并收取了款项，收款方就有义务开具发票。

2. 逾期付款与发票开具的关系：

   • 逾期付款并不改变经营业务的本质和发票开具的义务。即使对方逾期付款，只要最终支付了款项（无论是本金还是包括利息等其他费用），收款方仍应按照实际收取的款项开具发票。

3. 发票开具的内容：

   • 如果对方只还了本金，且双方没有约定逾期利息或其他费用，那么发票上应仅反映本金的金额。
   • 如果双方有约定逾期利息或其他费用，且对方在付款时一并支付了这些费用，那么发票上应反映包括本金和这些费用在内的总金额。但根据您的描述，对方只还了本金，所以发票上应只开具本金的金额，除非双方有特别约定且对方同意支付并要求开具相应发票。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 收款方在开具发票时，应确保发票的真实性、合法性和准确性，不得虚开、伪造或变造发票。
   • 如果对方对发票的开具内容有异议或要求开具不符合实际情况的发票，收款方应拒绝并说明原因，必要时可寻求法律帮助。

建议：

• 作为收款方，您应按照实际收取的本金金额开具发票，并确保发票的合法性和准确性。
• 如果对方对发票的开具内容有特别要求或异议，您应与对方沟通并明确双方的权利和义务，必要时可咨询专业律师以获取更具体的法律建议。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。